使用泛基因组构建工具,我最终得到了一个我不熟悉的格式的数据库,理论上应该可以通过Neo4j浏览器进行浏览。然而,我似乎找不到任何方法来实现这一点,除了该工具的作者提供的手册说明之外,任何参考文献中都没有提到如何做到这一点。
我已经尝试使用Neo4j社区版服务器(v.3.5.3)来执行此操作,其中的示例文件与说明所建议的相同,但它似乎没有检测到只显示默认数据库的数据库。
本教程中提到的部分可以在这里找到:https://www.bioinformatics.nl/pangenomics/manual/tutorial_part3/
发布于 2021-06-06 04:09:36
因此,将数据库内容复制到neo4j data文件夹。完成后,打开neo4j.conf文件并设置以下配置:
dbms.default_database=chloroplast_DB我不太确定这是不是数据库名称,请使用与数据库文件夹相同的名称,然后启动数据库。
https://stackoverflow.com/questions/67852143
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