问有没有办法在R中挖掘PGLMM_compare模型(Phyr和MuMin包)？
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Stack Overflow用户

提问于 2021-04-23 17:44:13

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我正在做一个比较分析，我的响应变量是0或1，因此我需要做一个具有二项误差分布的系统发育校正分析。我使用phyr包(https://rdrr.io/github/daijiang/phyr/man/pglmm_compare.html)中的PGLMM_compare函数创建了一个包含所有变量的完整模型，但MuMin不支持将此输出作为“全局模型”，因此我无法对其进行挖掘。我正在寻找一种方法来找到最好的模型，并可能执行模型平均从这些，但似乎这些包是不兼容的。手工创建所有的模型是很困难的，因为我有大约8个解释变量。有没有办法挖掘具有二项式误差结构的系统发育模型？提前谢谢。

phylogeny

mumin

回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2021-04-27 04:57:24

要使用pglmm_compare，您至少需要为dredge和model.avg实现以下方法

nobs.pglmm_compare(object, ...) 
logLik.pglmm_compare(object, ...)
coef.pglmm_compare(object, ...) 
coefTable.pglmm_compare(model, ...)

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/67227660

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