如何从包含bsub命令tcl脚本、csh脚本运行csh脚本？

Question

我正在尝试在tcl脚本中运行csh脚本。csh脚本中包含bsub命令。当我尝试运行脚本时，它错误地说bsub: Command not found。

脚本样本：

exec cp -r x  ../                           
cd ../../my_area                          
exec cp -r y ../../                           
cd ../../my_scripts                 
exec /bin/csh/  aim.csh  >@stdout 2>@stderr                   
# also tried set hd aim.csh , exec /bin/csh $hd >@stdout 2>@stderr}

aim.csh的详细信息

setenv IDC $d                                                
setenv LGH $f                                          
set error   $e                                                
bsub -q normal  -db  <path>  

Answer 1

调用脚本的正确方式如下所示：

exec /bin/csh aim.csh >@stdout 2>@stderr

在运行之前，您可能希望确保aim.csh文件存在。在任何cd调用之后执行此操作非常重要；这会改变代码查找aim.csh的位置。

如果您遇到bsub不在可执行文件搜索路径上的问题，那么这完全不是Tcl和csh的错。(我不知道它会在哪里，也记不清哪个包提供了它。)如果需要，可以从Tcl代码扩展可执行文件搜索路径：

# Before calling exec; after is too late
append env(PATH) :/path/to/directory

例如，如果bsub实际上是/opt/local/somewhere/bin/bsub，那么您应该这样做：

append env(PATH) :/opt/local/somewhere/bin

要做到这一点，一种真正合适的方法是使用以下过程：

proc addToPath {directory} {
    global env tcl_platform
    if {[file type $directory] ne "directory"} {
        error "must pass a directory name"
    }
    append env(PATH) $tcl_platform(pathSeparator) [file nativename $directory]
    return
}

addToPath /opt/local/somewhere/bin

但是对于不可移植的代码，简单的append已经足够好了。