R install.package在数据上失败-找不到原始文件

Question

我正在构建一个R包，其中包含一些相关数据。我使用usethis:：functions创建了一个data-raw文件夹，在其中放置了各种txt文件，并构建了R代码来生成.rda/Rdata文件。我已经使用use_data()函数生成了.rda和Rdata文件，我可以在/data中看到这些文件。

我可以使用load_all()检索这些对象。

然后，我构建了一个源包，它会生成一个压缩的tar-ball。

最后，我尝试在另一个项目中安装tar-ball/包，并获得：

 devtools::install_local("/home/fred/Rprojects/evidently/evidently_0.0.2.1.tar.gz")
✓  checking for file ‘/tmp/Rtmp53yb8S/remotes2eaf7a4fc2cb/evidently/DESCRIPTION’ ...
─  preparing ‘evidently’:
✓  checking DESCRIPTION meta-information
─  checking for LF line-endings in source and make files and shell scripts
─  checking for empty or unneeded directories
─  building ‘evidently_0.0.2.1.tar.gz’
   
Installing package into ‘/home/rob/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.0’
    (as ‘lib’ is unspecified)
    * installing *source* package ‘evidently’ ...
    ** using staged installation
    ** R
    ** data
    *** moving datasets to lazyload DB
    ** byte-compile and prepare package for lazy loading
    Error : **'/tmp/Rtmp0PbObQ/R.INSTALL391126f5cc7c/evidently/data-raw/TPBULET-A.txt' does not exist.**
    Error: unable to load R code in package ‘evidently’
    Execution halted
    ERROR: lazy loading failed for package ‘evidently’
    * removing ‘/home/fred/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.0/evidently’
    * restoring previous ‘/home/rob/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.0/evidently’
    Error: Failed to install 'evidently' from local:
      (converted from warning) installation of package ‘/tmp/Rtmp53yb8S/file2eaf5f6ca68c/evidently_0.0.2.1.tar.gz’ had non-zero exit status
    > 

但它说要查找的文件在包文件夹中的data-raw中。

我在这里遗漏了一些明显的东西。我欢迎关于为什么系统看不到txt文件，以及为什么它因此中止安装的建议。

Answer 1

当你在一个你认为已经清除的文件中有一个指向data-raw文件的恶意链接时，就会发生这种情况，当它作为install-packages的一部分被加载时，它会试图在data-raw/中找到一个不在这个包中的文件，因为data-raw/不是这个包的一部分，而只是在源代码中。因此，搜索您的文件并找到被遗忘的代码。羞愧地低下头。