问我如何从我的数据框中设置特定基因的子集？
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Stack Overflow用户

提问于 2021-01-21 07:58:21

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我有一个5911个细胞的数据帧(作为列)，其中包含来自22k个基因的表达数据(作为行)。我还有一个包含100个特定基因的载体。我如何对数据框进行子集，以便只获得100个特定的基因，而不是所有22k个基因？

我尝试过newdf <- subset(df, subset = genelist)，但它给我的错误是“‘子集’必须是逻辑的”。我不知道该怎么做，我在谷歌上搜索的所有东西也都没有帮助。

很抱歉，如果这是一个简单的问题，我对R的使用非常陌生。

发布于 2021-01-21 08:01:40

您可能需要%in%来查看列gene中的元素是否出现在genelist中，例如，

subset(df, subset = gene %in% genelist)

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/65819379

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