Owlrady2从文件而不是url加载导入的本体

Question

我正在尝试加载一个本体，该本体导入了其他一些本体。这些其他的本体位于我的机器上，而不是web上。如果我尝试使用my_ontology.load()，它会尝试从它们的URI加载这些其他的本体。但这失败了。我如何告诉owlready2这些本体的位置？

The traceback looks like this:

    Traceback (most recent call last):
  File "~Software/PyOntologyChecker/app.py", line 12, in <module>
    covid_onto = get_ontology_from_file(COVID_ONTOLOGY)
  File "~Software/PyOntologyChecker/app.py", line 8, in get_ontology_from_file
    return get_ontology("file://" + file_path).load()
  File "~.local/lib/python3.8/site-packages/owlready2/namespace.py", line 813, in load
    imported_ontologies = [self.world.get_ontology(self._unabbreviate(abbrev_iri)).load() for abbrev_iri in self.world._get_obj_triples_sp_o(self.storid, owl_imports)]
  File "~.local/lib/python3.8/site-packages/owlready2/namespace.py", line 813, in <listcomp>
    imported_ontologies = [self.world.get_ontology(self._unabbreviate(abbrev_iri)).load() for abbrev_iri in self.world._get_obj_triples_sp_o(self.storid, owl_imports)]
  File "~.local/lib/python3.8/site-packages/owlready2/namespace.py", line 773, in load
    except:  raise OwlReadyOntologyParsingError("Cannot download '%s'!" % f)
owlready2.base.OwlReadyOntologyParsingError: Cannot download 'http://ontofox.hegroup.org/CHEBI_module11.owl'!

Answer 1

假设您有CHEBI_module11.owl依赖项的本地副本(例如，SOME_DIR/HEBI_module11.owl)，将其位置添加到onto_path中(如docs中所述)：

onto_path.append("SOME_DIR")

在做my_ontology.load()之前。这将告诉Owlready2在SOME_DIR中查找文件。路径可以是相对路径，也可以是绝对路径(如c:/data/ontologies)。

当前Python的工作目录是，默认情况下不扫描，但可以使用onto_path.append(".")进行设置。

如果所需的本体由URI描述，而不是以通常的文件名结尾，如"http://rdf.webofcode.org/woc/"，则本地文件名(在本例中为woc)不应具有扩展名。