如何使面积图覆盖其下方的所有区域？

Question

我试着用pandas-bokeh包做一个面积图，代码如下：

import pandas as pd
import numpy as np
import pandas_bokeh

df = pd.read_excel('D:/Coding Practice/data/data_corona_usa.xlsx')
df = df.iloc[::-1].reset_index()
df['Cummulative Cases'] = df['cases'].cumsum()
df['date'] = df['dateRep'].dt.strftime('%D')


#to make it appear in your notebook
pandas_bokeh.output_notebook()

df.plot_bokeh(
    kind='area',
    x= 'dateRep',
    y='Cummulative Cases',
    xlabel = 'Date',
    ylabel = 'Cummulative Cases',
    hovertool_string= r'''<h1> Date: @{date} </h1>
        <h2> Cummulative Cases: @{Cummulative Cases} </h2>''',
    title='US Corona Cases (cummulative)',
    hovertool=True,
    fontsize_title=18,
    logy=True,
    stacked=False,
    legend='top_left'
)

但得到的面积图就像这张图。

strange area chart

图表没有覆盖该未知对角线下的区域。这个结果的出现是因为代码"logy = True“使得ytick使用了对数刻度。如果我删除这一行代码，面积图将显示为正常。

normal area chart

即便如此，我还是希望面积图在y轴上使用对数刻度。我怎么才能修复它？

Answer 1

首先，你必须明白你的最小例子并不是一个工作的例子。您的本地路径使重现行为变得非常困难，因为没有人能够像您一样加载数据。

其次，我必须告诉你，如果你想使用pandas-bokeh，你的问题是无法解决的。这是因为面积图在这个模块中是用零初始化的，如果你使用一个对数y轴，零就不存在了，。原因是没有定义log(0)。您可以看到的是默认行为。

如果您愿意切换到bokeh本身，欢迎您遵循这个最小的示例：

下面是一些示例数据：

import pandas as pd
df = pd.DataFrame({'cases':range(100)}))
df['Cummulative Cases'] = df['cases'].cumsum()
df 

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现在我们想用简明易懂的语言重现你的观察结果。

from bokeh.io import show, output_notebook
from bokeh.plotting import figure
from bokeh.models import ColumnDataSource
output_notebook()

p = figure(x_range=(0, 100), y_range=(0.1,100000),y_axis_type="log")
source = ColumnDataSource(dict(x=df['cases'].values, 
                               y1=df['Cummulative Cases'].values, 
                               y2=[0]*df.shape[0]
                              )
                          )
p.varea(x='x', y1='y1', y2='y2', source=source)
show(p)

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如果你设置了不同于零的基线，可能会像你想要的这个y2=[0.01]*df.shape[0]。

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