生命周期图颠倒

Question

我正在学习使用lifelines library进行生存分析。我正在使用leukemia dataset。我在试着绘制生命周期图。然而，我得到了一个颠倒的图(即，垂直翻转)。

我正在使用这个notebook作为参考。这是我的代码：

import lifelines
import matplotlib.pyplot as plt
from lifelines.datasets import load_leukemia
leukemia = load_leukemia()
durations = leukemia.t.values
events = leukemia.status.values
ax = lifelines.plotting.plot_lifetimes(durations=durations, event_observed=events)
ax.set_xlim(0, 40)
ax.set_xlabel("Time in Months")
plt.plot()

这就是我得到的情节

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这是我想要生成的图：

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Answer 1

虽然我不确定哪个图是正确的，但lifelines API在2019年3月21日更新了(v.0.20.2)。根据changelog

plot_lifetimes在打印时不再反转顺序。

github笔记本的日期是2019年3月11日，所以我假设它使用的是旧的API，这将导致其中所描述的情节。但是，所有未来版本的lifelines都将生成您所得到的绘图。

因此，基本上，如果您卸载当前的lifelines包和pip install lifelines==0.24.13 (v.0.24.13是最新的lifelines版本)，您将得到您正在获得的绘图。

卡梅隆·戴维森(lifelines的作者)可能会对此有更多的了解--也许白血病数据集需要在API更改后进行更新！