使用graphviz读取.mtx格式

Question

我使用以下graphviz代码来读取市场图形格式(.mtx)。

from graphviz import Source
path = '/path/to/dot_file'
s = Source.from_file(path)
s.view()

格式描述为here，我写了这篇内容

4 4 6  
2 1  
3 1  
3 2  
4 1  
4 2  
4 3 

然而，我得到了这个错误：

    s.view()
  File "/home/mahmood/.local/lib/python2.7/site-packages/graphviz/files.py", line 242, in view
    quiet=quiet, quiet_view=quiet_view)
  File "/home/mahmood/.local/lib/python2.7/site-packages/graphviz/files.py", line 209, in render
    quiet=quiet)
  File "/home/mahmood/.local/lib/python2.7/site-packages/graphviz/backend.py", line 221, in render
    run(cmd, capture_output=True, cwd=cwd, check=True, quiet=quiet)
  File "/home/mahmood/.local/lib/python2.7/site-packages/graphviz/backend.py", line 184, in run
    output=out, stderr=err)
graphviz.backend.CalledProcessError: Command '['dot', '-Tpdf', '-O', 'graph.mtx']' returned non-zero exit status 1 [stderr: "Error: graph.mtx: syntax error in line 1 near '4'\n"]

假设graphviz支持.mtx格式。那我怎么解决这个问题呢？我应该指定更多的选项吗？

Answer 1

graphviz不支持直接读取市场矩阵图形文件。Source文档不包括对MTX文件的直接读取的引用，dot程序的命令行文档也不包括(由您的代码/应用编程接口暗中使用)。

Linux2.40.1版上的graphviz库和工具安装确实包含一个名为mm2gv的程序，该程序可将MTX文件转换为dot语言。我没有看到任何通过Python调用此工具的引用，所以我想您最好的选择是将此工具作为一个子流程手动调用。您甚至可以将其输出通过管道传输到正在构建的Source对象。