在redcap中导入csv文件时的自定义数据验证

Question

有没有办法创建一个自定义的验证器来验证从REDCAP中的csv文件导入的数据？

Answer 1

我不完全明白你的意思，但我会尽量回答你的问题。

首先，您可以在REDCap中自定义在每个字段级别上使用的验证，只需编辑字段并选择字段类型即可。例如，如果它是一个激活了' integer‘约束的'text’字段，则会检查上传的.csv文件中该字段的数据，以确保只导入整数值。您也可以添加一些额外的约束，例如使用最小/最大值或操作标记(link to PDF document about action tags)。请注意，如果您使用“多项选择”/“复选框”类型的字段，您手动指定有限数量的可能字段选项，则将检查上传的数据，以确保该字段的所有值都在允许的字段选项列表中。

如果你的意思是你想绕过REDCap的验证过程，这样它就允许上传一些通常无效的值(比如，带有'integer‘约束的'text’字段的值是2.5 )，我认为这是不可能的，我也不认为有任何好的理由要这样做。如果您希望字段在验证方面不那么“宽松”，那么您可以将其类型更改为更通用的类型。因此，如果你有一个带有“整型”约束的“文本”字段，你可以简单地删除“整型”约束，让它成为一个普通的“文本”字段。但是如果你这样做的话一定要小心。想一想，你是因为实际上不允许上传有效数据而删除约束，还是试图上传应该删除或修复的无效数据。如果是后者，您肯定应该让验证保持原样，因为这样它就完成了它的工作，并让您知道需要更正的内容。

如果你想添加额外的验证，使其比REDCap目前所做的更严格，那么你当然可以将字段类型更改为更窄，例如，为“文本”字段添加“整数”约束，或将“文本”字段更改为“多项选择”字段。这就是REDCap中的解决方案。如果您想添加REDCap不支持附加约束/验证，我认为您必须在上传之前对数据进行预处理。如果你想自动化验证过程，你可以用R或Python编写一个脚本：

1. 导入字符串数据(例如，以你想要的方式导入数据)(例如，如果你想排除某些有模式的字符串，你可以使用R的‘.csv’包或Python的're‘package)
2. Uploads数据到REDCap使用REDCap应用编程接口(对于R是'redcapAPI'包，对于Python是'PyCap'包)请注意，你需要一个REDCap密钥，你可以向你机构的REDCap管理员要，如果你想让你的脚本直接上传数据。当然，您也可以创建一个脚本，生成用于上传的.csv文件，而不是直接上传数据。

如果您不太熟悉R、Python或其他编程语言/工具，那么最好使用REDCap本身为您提供的验证脚本。