python中的HDF5 :读取文件

Question

我以前用过这个，没有问题，但它突然不起作用了：

import scipy.io
import numpy as np
import h5py
f = h5py.File('Dv25.mat','r')
D = f["Dv25"]

输出：

Traceback (most recent call last):

  File "C:/Users/jonathan/Documents/Forskning/P1/Datab/Felles/Matart/Felles/datab.py", line 5, in 
<module>
    D = f["Dv25"]
  File "h5py\_objects.pyx", line 54, in h5py._objects.with_phil.wrapper
  File "h5py\_objects.pyx", line 55, in h5py._objects.with_phil.wrapper
  File "C:\Program Files\Python38\lib\site-packages\h5py\_hl\group.py", line 264, in __getitem__
    oid = h5o.open(self.id, self._e(name), lapl=self._lapl)
  File "h5py\_objects.pyx", line 54, in h5py._objects.with_phil.wrapper
  File "h5py\_objects.pyx", line 55, in h5py._objects.with_phil.wrapper
  File "h5py\h5o.pyx", line 190, in h5py.h5o.open
KeyError: "Unable to open object (object 'Dv25' doesn't exist)"

但是，键入f会得到以下结果：

>>> f
<HDF5 file "Dv25.mat" (mode r)>

将Dv25.mat换成Dv25或使用‘或’都无济于事。

这个问题的原因是什么?我如何解决它？很明显，这个文件就在“那里”

谢谢！

最好的，J

Answer 1

一些h5py/HDF5基础知识：

f是一个文件对象。

f['Dv25']是一个对象引用(组或数据集)。在本例中，它是根级别('/')中名为'Dv25‘的节点。显然，您的文件中不存在同名的对象。

使用f.keys()获取根级别的对象。这将返回根级对象的视图；它们可以是组或数据集。您可以对它们进行迭代以获得名称。要打印，请使用以下循环：(它应该标识根级别名称)：

for i in f.keys():  
    print (i)

注意:通常来自于.mat，它可以选择编写HDF5格式的文件。请确保这是以该格式编写的。