将metafor::rma与broom::tidy一起使用？

Question

我是一个完全的R新手，我想做以下事情：

library(metafor)
library(broomExtra)

df <-
  escalc(
    measure = "RR",
    ai = tpos,
    bi = tneg,
    ci = cpos,
    di = cneg,
    data = dat.bcg
  )

meta_analysis <- rma(yi, vi, data = df, method = "EB")

meta_analysis

tidy(meta_analysis)

为什么tidy(meta_analysis)总是给我NULL

Answer 1

如果broom中没有整理器，可以使用broomExtra::tidy_parameters函数

library(metafor)
#> Loading required package: Matrix
#> Loading 'metafor' package (version 2.1-0). For an overview 

df <-
  escalc(
    measure = "RR",
    ai = tpos,
    bi = tneg,
    ci = cpos,
    di = cneg,
    data = dat.bcg
  )

meta_analysis <- rma(yi, vi, data = df, method = "EB")

broomExtra::tidy_parameters(meta_analysis)
#> # A tibble: 1 x 8
#>   term    type    estimate std.error statistic   p.value conf.low conf.high
#>   <chr>   <chr>      <dbl>     <dbl>     <dbl>     <dbl>    <dbl>     <dbl>
#> 1 overall summary   -0.715     0.181     -3.95 0.0000774    -1.07    -0.360

Answer 2

已查看文档(?tidy)。对于rma类的对象，似乎没有整洁的方法。来自broomExtra::tidy的文档

检查给定对象是否存在整洁方法，无论是在broom中还是在broom.mixed中。如果是，它会将一个对象转换成整齐的，如果不是，则返回一个空tibble。如果是数据帧，则返回tibble数据帧。