在RETICULATE_PYTHON环境变量中指定网格化python路径

Question

每当我在RStudio中使用reticulate时，默认的REPL都是使用python2.7，但我希望默认使用python3。我已经在环境变量RETICULATE_PYTHON中将python3的python路径添加到我的.bashrc中，当我从命令行使用R和reticulate时，Sys.getenv('RETICUALTE_PYTHON')返回/usr/bin/python3。如果在命令行中使用打开REPL，我会得到正确的路径。如果我在RStudio中执行同样的操作，我会得到一个空字符串。

R

Sys.getenv('RETICULATE_PYTHON')

在R中返回(从命令行)：

[1] "/usr/bin/python3"

在RStudio中：

[1] ""

在RStudio终端中，输出正确：

echo $RETICULATE_PYTHON
/usr/bin/python3

另外，当我从命令行启动R时，py_config()是：

> library(reticulate)
> py_config()
python:         /usr/bin/python3
libpython:      /usr/lib/python3.6/config-3.6m-x86_64-linux-gnu/libpython3.6.so
pythonhome:     /usr:/usr
version:        3.6.7 (default, Oct 22 2018, 11:32:17)  [GCC 8.2.0]
numpy:          /usr/lib/python3/dist-packages/numpy
numpy_version:  1.14.5

NOTE: Python version was forced by RETICULATE_PYTHON

但在RStudio中是这样的：

> library(reticulate)
> py_config()
python:         /usr/bin/python
libpython:      /usr/lib/python2.7/config-x86_64-linux-gnu/libpython2.7.so
pythonhome:     /usr:/usr
version:        2.7.15+ (default, Oct  2 2018, 22:12:08)  [GCC 8.2.0]
numpy:          /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy
numpy_version:  1.14.5

python versions found: 
 /usr/bin/python
 /usr/bin/python3

重新启动RStudio无济于事。关于如何让RStudio也使用正确的python二进制文件，有什么建议吗？

Answer 1

当遇到类似的问题时，我通过在加载reticulate包之前指定Python配置来解决它：

Sys.setenv(RETICULATE_PYTHON = "C:\\ProgramData\\Anaconda3")
library(reticulate)

Answer 2

The documentation说在.Rprofile中设置它

Sys.setenv(RETICULATE_PYTHON="/path/to/your/preferred/python")

如果你总是想要一个固定的Python。否则，执行as @nba2020 suggests以在特定脚本中设置它。

Answer 3

我使用的解决方案是使用工具>全局选项将RStudio的默认Python解释器设置为我希望RStudio使用的解释器的路径。

在我的例子中，我也使用"C:/tools/Anaconda3/envs/dev/python.exe“来设置它。

我假设同样的解决方案也适用于Linux。

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