如何从带数据验证的REDCap表单读取到R (REDCapR::readcap_read)

Question

我一直在使用REDCapR包从我的调查表单中读取数据。我一直在使用redcap_read读取数据，直到我意识到我需要在我的调查中的一个问题上添加一个字段限制。最初，它是一个简短的回答字段，询问用户他们有多少东西，人们正在做一些意想不到的恼人的事情，比如拼写数字或输入“几个”而不是数字。但所有这些数据都读取得很好。我将该字段更改为一个简短回答字段(与前面的类型相同)，要求响应为整数，现在数据将不会使用redcap_read读取到R中。

当我运行时：

redcap_read(redcap_uri=uri, token=api_token)$data

我得到的错误消息是：

Column [name of my column] can't be converted from numeric to character

我还注意到，当我查看它在该列的第一个和第六个记录(都是零)中读取的数据时(从800+记录中读取)，但其他所有记录都是NA。尝试从限制为整数的文本字段读取数据是否存在固有问题，或者是否有其他方法可以做到这一点？

编辑:它还可以很好地读取日期，这些日期是有日期字段限制的文本字段。这似乎非常特定于从文本字段中读取经过验证的数字。

我还尝试了redcapAPI::exportRecords，它将继续读取数据集的其余部分，但会读取具有测试限制的列中所有值的NA。

Answer 1

将REDCapR升级到GitHub上的版本，该版本会在确定数据类型之前将批处理堆叠在一起(请参见#257)。

# install.packages("remotes") # Run this line if the 'remotes' package isn't installed already.
remotes::install_github(repo="OuhscBbmc/REDCapR")

在您的示例中，我相信批处理(默认情况下为200条记录)包含不同的不同数据类型(根据错误消息，是字符和数字)，它们不会静默地堆叠在一起。

然后，REDCapR::redcap_read()函数应该可以工作了。(如果没有，请创建一个新的issue)。

有两种替代方案

1. 使用较大的guess_max值调用redcap_read_oneshot，或
2. 使用guess_type = TRUE.

调用redcap_read_oneshot