在R中使用两个数据帧进行PCR

Question

我是一名生物学家，我在几个地方做过生物多样性的研究。此外，我在这些地块中测量了环境变量。通常，我会在Canoco5中分析这些数据，但是，我也在尝试学习R。我的数据框如下所示：

          Arthopleidae Baetinae Cloeninae Caenidae etc.
Location_1           0        3        16        0
Location_2           0        0         0        5
Location_3           0        1        40        0
Etc.

和：

                    pH  Temperature Vegetation etc.
Location_1         8.22       28.06          0
Location_2         8.15       28.95         30
Location_3         8.29       28.75          0
Etc.

我找不到适合这种分析的软件包。你有什么建议吗？

提前感谢！

Answer 1

看看vegan package (在CRAN或GitHub中可用)。它拥有Canoco5中所有可用的排序方法，并将will与其他R包(例如，动物园、整洁)集成在一起。我认为vegan是Canoco的现代“临时”替代品，并且也有一些可用的非参数方法(例如，非度量MDS)。

这里是包的描述。

，素食包为描述性社区生态提供了工具。它具有多样性分析、群落排序和差异性分析等最基本的功能。它的大多数多变量工具也可以用于其他数据类型。