错误：'glmnet_softmax‘不是从'namespace:glmnet’中导出的对象

Question

我尝试使用本教程https://github.com/wvictor14/planet#infer-ethnicity，并得到以下错误消息，即使使用提供的测试数据也是如此：

pl_infer_ethnicity(pl_betas)
[1] "1860 of 1860 predictors present."
Loading required package: Matrix
Error: 'glmnet_softmax' is not an exported object from 'namespace:glmnet'

我尝试重新安装单独的软件包，并在新版本或R中运行，但得到了相同的错误。我相信这与glmnet最近更新时发布的其他错误有关。有什么关于如何解决的提示吗？

sessionInfo()
R version 3.6.2 (2019-12-12)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 17134)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252 
[2] LC_CTYPE=English_United States.1252   
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C                          
[5] LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] Matrix_1.2-18 planet_0.1.0 

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] lattice_0.20-38  codetools_0.2-16 glmnet_3.0-2     foreach_1.4.7   
 [5] crayon_1.3.4     grid_3.6.2       magrittr_1.5     pillar_1.4.2    
 [9] rlang_0.4.2      remotes_2.1.0    iterators_1.0.12 tools_3.6.2     
[13] compiler_3.6.2   pkgconfig_2.0.3  shape_1.4.4      tibble_2.1.3    

Answer 1

我不知道为什么它一开始就能工作；glmnet的NEWS file没有说明任何关于glmnet_softmax的事情(例如，它没有说"glmnet_softmax不再被导出“或类似的东西……)

在任何情况下，这都是一个未从glmnet包中导出的函数。它在教程代码中被称为here。

如果您可以将该行代码更改为引用glmnet:::glmnet_softmax (即，三个冒号而不是两个)，这应该就足够了(:::允许您访问非导出函数)。