OpenSlide.read_region函数有什么问题吗？

Question

我正在使用openslide包的python API来读取一些ndpi file.When，我使用read_region函数，有时它会返回一个奇怪的图像。可能会发生什么问题？

我已经尝试阅读完整的图像，它将很好地工作。因此，我认为原始文件没有问题。

from openslide import OpenSlide
import cv2
import numpy as np

slide = OpenSlide('/Users/xiaoying/django/ndpi-rest-api/slide/read/21814102D-PAS - 2018-05-28 17.18.24.ndpi')
image = slide.read_region((1, 0),6, (780, 960))
image.save('image1.png')

输出是奇怪的output

Answer 1

正如read_region文档所述，x和y参数始终位于level 0的坐标空间中。对于您想要的行为，您需要将这些参数乘以您正在读取的电平的下采样。

Answer 2

这似乎是一个与版本相关的错误，另请参阅

https://github.com/openslide/openslide/issues/291#issuecomment-722935212

这个问题似乎与libpixman版本0.38.x有关。有一个由GunnarFarneback编写的变通方法部分建议首先加载不同的版本，例如

导出LD_PRELOAD=/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpixman-1.so.0.34.0

更简单的解决方案是：

我们正在使用Python 3.6.8+，这为我们做了一个小把戏: conda install pixman=0.36.0