ncks:参数列表太长

Question

我正在尝试使用data.txt的data.txt头中给出的两个in从.nc文件中提取点信息

AID CID
 730 285
 535 290
 736 291

如果这段代码有任何问题，你能提供帮助吗？我在widows和anaconda Linux中使用Ubuntu，得到一个错误“参数列表太长”。

ids=`head -6 data.txt | awk '{if(NR>1) print $1}'`
echo $ids
ids=`cat data.txt | awk '{if(NR>1) print $1}'`
for id in $ids
do 
  aid=`cat data.txt | awk '{if($1=='${id}') print $1}'`
  rch=`cat data.txt | awk '{if($1=='${id}') print $2}'`
  index=`ncks -v rid ./file.nc | grep "$rch" | sed -e 's/rid\[//g' |awk 'BEGIN{FS="]"}{print $1}'`
  echo id=$id aid=$aid rch=$rch index={$index}
  ncks -O -v Qout -d rid,$index ./file.nc > temp.nc
 /bin/mv temp.nc data_aid${aid}_cid${rch}.nc
done

最后，我期望得到；

data_730_285.nc
data_535_290.nc
data_736_291.nc
.......

Answer 1

我猜这个错误可能来自第二个ids赋值。您可以通过管道传输数据来解决此问题，而不是将其存储在变量中：

tail -n +2 data.txt | while read aid rch
do
  # ...  
done

备注：

aid=$id

• I不知道ncks是做什么的，但随后的grep "$rch"似乎容易出现误报(数字可以包含在其他数字中(例如，.123也在12345))

• /bin/mv temp.nc data_aid${aid}_cid${rch}.nc中，应该类似于/bin/mv temp.nc data_${aid}_${rch}.nc