pydicom标签可以通过点符号访问吗？

Question

一个非常简单的pydicom示例涉及读取文件，然后输出Series Time

import pydicom
info = pydicom.dcmread("file.dcm")
print(info.SeriesTime)

因此，对于已被读取的对象，点表示法可以替代更复杂的构造，如print(info[pydicom.tag.Tag((0x0008, 0x0031))])或print(info[0x0008, 0x0031])。好的。

现在，pydicom只支持读取一些标签，以提高性能：

info = pydicom.dcmread("file.dcm", specific_tags=['SeriesTime', ])

我不喜欢在代码中使用字符串常量。那么在上面的例子中，'SeriesTime'的可读性有哪些呢？specific_tags=[pydicom.tag.Tag((0x0008, 0x0031)), ]的可读性并不是特别好。

理想情况下，我希望能够通过点符号访问标记字典，比如pydicom.allTags.SeriesTime，但我似乎找不到它。

Answer 1

这是获取 pydicom 字典的另一种相对简单的方法：

from pydicom.datadict import tag_for_keyword
from pydicom.tag import Tag

class DottedDcmDict(object):
    def __getattr__(self, name):
        tag = tag_for_keyword(name)
        if tag:
            return Tag(tag)
        raise AttributeError("Not a valid DICOM identifier")

dd = DottedDcmDict()
print(dd.SeriesTime)
(0008, 0031)

Answer 2

您要查找的是数据字典。在Pydicom中，您可以在以下位置找到它：pydicom.datadict.DicomDictionary，但这是一个元组字典，并不适合通过点表示法访问。例如，要检索“SeriesTime”，您必须编写pydicom.datadict.DicomDictionary[524337][4]，它既不可读，也不能保证在更新Pydicom时保持有效(尽管我怀疑它是否会经常更改)。

你可以用一个命名的元组自己来实现：

from collections import namedtuple
import pydicom

def get_dict_as_namedtuple(pdict):
    # some keywords are empty, check for those
    keywords_list = [pdict[i][4] for i in pdict if pdict[i][4].strip() != '']
    Keywords = namedtuple('Keywords', keywords_list)
    # unpack the list as positional arguments
    return Keywords(*keywords_list)

dicom_tags = get_dict_as_namedtuple(pydicom.datadict.DicomDictionary)

print(dicom_tags.SeriesTime)
# prints 'SeriesTime'

或者我最初的不太优雅的解决方案(tab自动补全不适用于我的解决方案)：

(通过this answer找到的Fabric codebase中的AttributeDict示例代码)

import pydicom
class AttributeDict(dict):

    def __getattr__(self, key):
        try:
            return self[key]
        except KeyError:
            # to conform with __getattr__ spec
            raise AttributeError(key)

    def __setattr__(self, key, value):
        self[key] = value

    def first(self, *names):
        for name in names:
            value = self.get(name)
            if value:
                return value

def get_data_dict(pydicom_data_dict):
        data_dict = AttributeDict({})
        for entry in pydicom_data_dict:
            keyword = pydicom_data_dict[entry][4]
            data_dict[keyword] = keyword
        return data_dict

pydicom_data_dict = get_data_dict(pydicom.datadict.DicomDictionary)
print(pydicom_data_dict.SeriesTime)
#prints 'SeriesTime'