不要使用R系统库

Question

我正在尝试使用安装了R的linux服务器。显然，R系统库安装了非基础软件包的旧版本，如dplyr和testthat。因为我没有编辑系统库的权限，所以我无法更新包。

我的计划是只使用一个用户库，这样我就可以自己控制包的版本。但是，我无法从.libPaths()中删除"/usr/lib64/R/library"文件夹。我尝试将环境变量R_LIBS_SITE和R_LIBS与.Renviron和.Rprofile文件一起更改到另一个文件夹，但/usr/lib64/R/library文件夹始终存在。使用命令.libPaths(.libPaths()[1:2])删除它也不起作用。

有没有办法从.libPaths()中删除系统库，这样我就不需要依赖服务器管理员的更新策略了？

Answer 1

您不能删除系统库，因为这是基包所在的位置。它们不能安装在其他地方，没有它们R就不能工作。

最好是让您的系统管理员更新系统库。这些过时的包可能包含错误。

如果您不能做到这一点，那么运行update.packages(instlib = "local")来安装"local"库中的所有最新版本。(当然，请替换您自己的本地lib名称。)这要求所有用户在启动时指定.libPaths("local")，有些用户可能会忘记，所以它不是很好。

对您来说，最简单的方法是在自己的帐户中安装R的完整副本。然后你就可以控制一切了，任何人使用你的副本都会得到你的库。

(10天后会有一个新的版本(3.5.3)；您可以等待，或者安装betas或RCs之一，现在应该可以使用，然后在最终版本到来时再次更新。)

Answer 2

对我来说，它可以使用

 .libPaths(.libPaths()[2:1])

这将仍然搜索系统库，但仅在搜索我的个人库之后，所以如果我有一个较新的版本，它将使用该库。注意：我使用的是.libPaths()[2:1]，而不是.libPaths()[1:2]