P值可调的R的Kruskal-Wallis检验

Question

我正在我的数据集上执行Kruskal-Wallis测试，我试图调整p值，但它似乎不起作用，以下是我的代码：

> kruskal.test(df$Folate_biosynthesis, df$Group, p.adj="holm")

        Kruskal-Wallis rank sum test

data:  df$Folate_biosynthesis and df$Group Kruskal-Wallis chi-squared
= 8.5144, df = 5, p-value = 0.1301

> kruskal.test(df$Folate_biosynthesis, df$Group, p.adj="none")

        Kruskal-Wallis rank sum test

data:  df$Folate_biosynthesis and df$Group Kruskal-Wallis chi-squared
= 8.5144, df = 5, p-value = 0.1301

正如你所看到的，如果我使用p.adjust = "none"，我得到了完全相同的结果。这怎么可能呢？

提前感谢所有愿意提供帮助的人。安德里亚

Answer 1

当你有多个p值时，通常会进行p值调整。你只有一个p值，所以我想知道你希望这里的调整是什么。

话虽如此，但也没有出现kruskal.test的p.adj参数。该函数有一个dots参数，但据我所知，它不会使用这些参数，也不会将这些参数传递给任何其他函数，因此任何不是命名参数的输入基本上都将被忽略。

如果您想从kruskal.test的多个输出中调整p值，您可以收集向量中的p值，并使用适当的方法将它们直接传递给p.adjust。

但话虽如此，还不清楚您希望实现什么--但很明显，尝试在kruskal.test中使用p.adj参数不是实现目标的方法。