安装模拟和日规-错误

Question

我想在Python中使用Assimulo和Sundials来解决微分代数方程，因此我正在尝试将其安装在Ubuntu上。

对于Sundials的安装，我遵循了安装说明，据我所知它工作得很好。

% cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/lib/sundials-3.1.1/  ~/opt/sundials/sundials-3.1.1
% make
% make install

然后我尝试用命令pip3 install Assimulo安装Assimulo，但是我得到了一条错误信息。我还尝试按照Installation - Assimulo 3.0 documentation上的说明下载安装文件，并使用以下命令进行安装。它会导致相同的错误消息。

sudo python3 setup.py install --sundials-home=/usr/local/lib/sundials-3.1.1

这是我得到的错误消息：

  target build/src.linux-x86_64-3.6/assimulo/thirdparty/hairer/dopri5module.c does not exist:
   Assuming dopri5module.c was generated with "build_src --inplace" command.
error: 'assimulo/thirdparty/hairer/dopri5module.c' missing

哪里出了问题，我该如何修复它？任何帮助都将不胜感激！

Answer 1

在pip安装numpy和cython之后，通过pip install assimulo在macos上安装时，我得到了同样的错误。对我来说，使用conda env成功了：

创建conda环境的

• ：conda create -n your_name_goes_here
• conda activate your_name_goes_here
• conda install python=3.6 (我注意到您也可以使用3.7)
• conda install -c conda-forge assimulo

Answer 2

我也有同样的错误信息。正如在另一个答案中所建议的，您可以从Conda获得一个已编译的包。但是如果你想自己从源代码编译，在我看来PyPI源代码tarball并不包含所有需要的文件。至少有一些*.pyf文件丢失。因此，我改用SVN repo：

svn checkout https://svn.jmodelica.org/assimulo/tags/Assimulo-3.0/ assimulo

通过编译这个源码树，我设法传递了您的原始错误，但我现在遇到了另一个构建错误，我还不知道如何解决：

ssimulo/solvers/sundials.c: In function '__pyx_f_8assimulo_7solvers_8sundials_5CVode_initialize_cvode':
assimulo/solvers/sundials.c:33274:31: error: too many arguments to function 'CVodeCreate'
     __pyx_v_self->cvode_mem = CVodeCreate(__pyx_t_3, __pyx_t_4);