链接器找不到为jupyter笔记本安装IHaskell内核-lgmp

Question

我正在尝试直接从instructions here在jupyter中安装IHaskell。

我运行了以下命令。

sudo apt-get install -y python3-pip git libtinfo-dev libzmq3-dev libcairo2-dev libpango1.0-dev libmagic-dev libblas-dev liblapack-dev    
git clone https://github.com/gibiansky/IHaskell
cd IHaskell
pip3 install -r requirements.txt
stack install gtk2hs-buildtools
# stack install --fast
# ihaskell install --stack
# jupyter labextension install ihaskell_jupyterlab

我在上面的第5条命令，即gtk2hs-buildtools命令中得到了这个错误：

(envname) me@machine:~/plc/IHaskell$ stack install gtk2hs-buildtools
Linking /home/me/.stack/setup-exe-cache/x86_64-linux/tmp-Cabal-simple_mPHDZzAJ_2.2.0.1_ghc-8.4.4 ...
/home/me/anaconda3/envs/envname/bin/../lib/gcc/x86_64-conda_cos6-linux-gnu/7.3.0/../../../../x86_64-conda_cos6-linux-gnu/bin/ld: cannot find -lgmp
collect2: error: ld returned 1 exit status
`x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cc' failed in phase `Linker'. (Exit code: 1)

--  While building simple Setup.hs using:
      /home/me/.stack/programs/x86_64-linux/ghc-8.4.4/bin/ghc -rtsopts -threaded -clear-package-db -global-package-db -hide-all-packages -package base -main-is StackSetupShim.mainOverride -package Cabal-2.2.0.1 /home/me/.stack/setup-exe-src/setup-mPHDZzAJ.hs /home/me/.stack/setup-exe-src/setup-shim-mPHDZzAJ.hs -o /home/me/.stack/setup-exe-cache/x86_64-linux/tmp-Cabal-simple_mPHDZzAJ_2.2.0.1_ghc-8.4.4
    Process exited with code: ExitFailure 1

一些搜索告诉我cannot find -lgmp是通过以下方式解决的：

$ sudo apt-get install libgmp3-dev

这是我干的。这已成功安装，但

(envname) me@machine:~/plc/IHaskell$ stack install gtk2hs-buildtools

仍然会产生相同的错误。哪里出了问题，我该如何修复它？

从scinart的建议更新

$ conda install gmp
Solving environment: done

## Package Plan ##

  environment location: /home/me/anaconda3/envs/envname

  added / updated specs: 
    - gmp


The following packages will be downloaded:

    package                    |            build
    ---------------------------|-----------------
    openssl-1.0.2p             |       h470a237_1         3.1 MB  conda-forge
    ca-certificates-2018.10.15 |       ha4d7672_0         135 KB  conda-forge
    certifi-2018.10.15         |        py36_1000         138 KB  conda-forge
    gmp-6.1.2                  |       hfc679d8_0         676 KB  conda-forge
    ------------------------------------------------------------
                                           Total:         4.0 MB

The following packages will be UPDATED:

    ca-certificates: 2018.03.07-0      --> 2018.10.15-ha4d7672_0 conda-forge
    certifi:         2018.10.15-py36_0 --> 2018.10.15-py36_1000  conda-forge
    openssl:         1.0.2p-h14c3975_0 --> 1.0.2p-h470a237_1     conda-forge

The following packages will be DOWNGRADED:

    gmp:             6.1.2-h6c8ec71_1  --> 6.1.2-hfc679d8_0      conda-forge

Proceed ([y]/n)? y


Downloading and Extracting Packages
openssl-1.0.2p       | 3.1 MB    | ######################################################################################################################################################################################################## | 100% 
ca-certificates-2018 | 135 KB    | ######################################################################################################################################################################################################## | 100% 
certifi-2018.10.15   | 138 KB    | ######################################################################################################################################################################################################## | 100% 
gmp-6.1.2            | 676 KB    | ######################################################################################################################################################################################################## | 100% 
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done

看起来不错！

(envname) me@machine:~/plc/IHaskell$ stack install gtk2hs-buildtools
Linking /home/me/.stack/setup-exe-cache/x86_64-linux/tmp-Cabal-simple_mPHDZzAJ_2.2.0.1_ghc-8.4.4 ...
/home/me/anaconda3/envs/envname/bin/../lib/gcc/x86_64-conda_cos6-linux-gnu/7.3.0/../../../../x86_64-conda_cos6-linux-gnu/bin/ld: cannot find -lgmp
collect2: error: ld returned 1 exit status
`x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cc' failed in phase `Linker'. (Exit code: 1)

--  While building simple Setup.hs using:
      /home/me/.stack/programs/x86_64-linux/ghc-8.4.4/bin/ghc -rtsopts -threaded -clear-package-db -global-package-db -hide-all-packages -package base -main-is StackSetupShim.mainOverride -package Cabal-2.2.0.1 /home/me/.stack/setup-exe-src/setup-mPHDZzAJ.hs /home/me/.stack/setup-exe-src/setup-shim-mPHDZzAJ.hs -o /home/me/.stack/setup-exe-cache/x86_64-linux/tmp-Cabal-simple_mPHDZzAJ_2.2.0.1_ghc-8.4.4
    Process exited with code: ExitFailure 1

见鬼，和以前一样的错误。

因此，从这里可以看出，我已经安装了gmp包，并且实际上已经有了更高的版本。问题似乎是由于某些原因，链接器无法找到gmp (即使它就在那里)，因此重新安装gmp将无济于事。

更新2

我尝试的另一件事是：

$ conda install gxx_linux-64

推荐的here，也不起作用。

更新3

This看起来也是同样的问题，用这种方式解决了，但对我不起作用。

Answer 1

2019年1月12日更新

我最近重新安装了最新的anaconda (Anaconda3-2018.12-Linux-x86_64.sh)。但这一次没有在上面安装任何gcc软件包(如gxx_linux-64)，也没有将我的特定环境的bin目录添加到我的$PATH (它安装在我的.bashrc文件中的代码片段似乎可以做到这一点)，default IHaskell instructions运行得很顺利，即使已经激活了conda我的conda环境。

原文：

出于我的目的，我希望jupyter的IHaskell能够学习Haskell，并在我学习时做一些笔记。我还在我的环境中使用了conda via anaconda，用于其他编程目的，并且得到了与上面相同的错误。所以..。另外，我设置了一个不基于conda的jupyter实例，这似乎起到了很好的作用。

然后，我将jupyter安装为全局二进制文件。在我的Ubuntu Linux案例中，它使用的是sudo apt install jupyter-notebook。然后，我在conda deactivate ; export PATH=/usr/bin:$PATH打开的终端窗口中有选择地停用了conda。

我还添加了一个指向本地libgmp的符号链接，以使其更易于查找。我发现使用libgmp.so.3符号链接工作得很好(即使它链接到较新的libgmp)。

$ sudo ldconfig -p | grep libgmp
  libgmp.so (libc6,x86-64) => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgmp.so
$ sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgmp.so /usr/lib/libgmp.so.3
$

然后我从带有gmp (stack-1.9.3-linux-x86_64-gmp4.tar.gz)的releases one下载了堆栈，并将其放在某个目录中，~/apps/stack，我将其添加到我的$PATH中，这样我就可以调用stack了。从那时起，通过禁用上面的每个命令的conda，来自IHaskell的指令变得更加流畅。我想我需要为可选的gtk2hs-buildtools to stack install (YMMV)添加allow-newer: true。

就这样，haskell内核已经安装好，可以使用了：

$ which ihaskell
/home/yuvilio/.local/bin/ihaskell
$ ihaskell install --stack
$ jupyter kernelspec list
Available kernels:
  haskell      /home/yuvilio/.local/share/jupyter/kernels/haskell
...
$

然后尤里卡，它成功了。我刚刚使用了全局安装的jupyter-notebook和jupyter-console (根据上面的说明，在该终端中禁用了conda )，haskell内核已经可用，并且工作正常：

$ jupyter-console --kernel=haskell
Jupyter console 5.2.0
IHaskell 0.9.1.0 GHC 8.6.3
In [1]: sum[1..5]
:15
In [2]: double x = x + x
In [3]: double 3
:6

我相信有一个更聪明的方法可以让IHaskell和conda一起工作，但听起来像是still in progress。这个设置的好处是，在其他终端屏幕上，我的conda在其他终端会话上工作得很好。这并不是一个很好的生产设置，但如果您只是想制作包含haskell内容的jupyter-notebook，这似乎已经足够好了。

Answer 2

简而言之，如果当你通过栈安装ghc时，你在其环境中启用了Anaconda，并在其环境中使用了gcc和ld，那么ghc将永远被破坏。一种解决方法是删除堆栈安装的ghc，conda uninstall ... Anaconda的gcc (可能是gcc_linux-64包)和ld ( binutils_linux-64和binutils_impl_linux-64包)，再次安装ghc (然后重新安装Anaconda的gcc和ld，如果你真的想要的话)。

有关更深入的分析，请参阅https://github.com/haskell/cabal/issues/5280#issuecomment-718818157。

Answer 3

所以，问题是/home/me/anaconda3/.../gcc/7.3.0/bin/ld: cannot find -lgmp

根据conda document的说法

编译器和链接器不查找系统头文件和库

建议使用conda进行安装。我们正在积极工作，以确保conda-forge也提供这些工具。

conda-forge的主页是https://conda-forge.org，用法是

conda config --add channels conda-forge
conda install gmp

这个gmp与debian/sid libgmp3-dev的版本相同，应该可以构建libgmp.so，请参阅this

希望它能起作用。