python3.7 biopython，如何学习python3并仍然使用biopython

Question

我对python和biopython非常陌生，目前使用的是mac。我有PythonV2.7和v3.7，我想学习python3。Biopython仅适用于v2.7。安装PythonV3.4以及其他2个版本，这样我就可以学习python3并使用biopython了吗？或者删除python3.7并添加3.4？即使我安装了python3.4，如果之前安装了biopython，它也可以工作吗？非常困惑的生物学家。

Answer 1

首先，查看这个页面：https://biopython.org/wiki/Download你不必担心biopython被绑定到特定版本的python -你可以在v2.7或v3.4/v3.5/v3.6中使用它。您也可以在您的系统上安装多个版本，但我建议您专注于深入研究其中的一个版本。就我个人而言，我现在已经使用python3.x工作了几年(目前是3.6)，但我知道很多人坚持使用v2.7。

也有一个生物信息学的背景，有一件事，我可以强烈推荐你在你的旅程的开始是参加这样的课程：https://www.coursera.org/specializations/python也有一堆免费的教程在youtube上-你可以很容易地找到一个符合你的需要，搜索"python教程“或"python入门”。

让自己熟悉这门语言，了解数据结构、数据库和数据可视化等基础知识。也可以查看一些"python小抄“--它们可以帮助你学习语言的基本概念。万事如意，继续编码！

Answer 2

来自biopython installation document

Python被设计为与

2.5到2.7一起工作。Python 2.7是最终的2.x系列发行版，这将是我们推荐的版本(假设您计划使用的所有其他Python库都支持它)。

升级错误修复版本(例如。2.6.1到2.6.2)非常简单，不需要重新安装库。

在不同版本(例如2.6到2.7)之间升级更加耗时，因为您需要重新安装所有添加到python中的库。

从Biopython 1.62开始，我们正式支持Python3，特别是Python3.3。不支持Python 3.0、3.1和3.2。

也来自Biopython website

PythonPython2.7、3.4、3.5或3.6或PyPy，包括python.h等Python开发头文件

所以biopython与他们的文档不一致。

我认为你最好的选择是下载最新版本的Python2或3，看看它是否可以工作。