Openslide:替换"label“图片

Question

我正在使用openslide-python来读取Mirax格式(mrxs)的整个幻灯片图像。现在我想用自定义的条形码图像替换“标签”条形码。不幸的是，

f.associated_images["label"] = label_new

加薪

TypeError: '_AssociatedImageMap' object does not support item assignment

我发现"label“引用存储在与图像相关的slidedat.ini文件中

NONHIER_0_VAL_3 = ScanDataLayer_SlideBarcode

但我不确定如何处理这些信息。

任何帮助都将不胜感激！

马里奥

Answer 1

openslide是在读取库，而不是在写。

您需要自己创建用于MIRAX支持的写入库。

在Dataxxx.dat中，您保留MIRAX标题和图像数据(以jpg或png格式)。在Index.dat中，您可以保存有关dat文件的信息(文件索引和文件大小)；在Slidedat.ini中，您可以放置有关条形码图像的信息：

NONHIER_0_VAL_3 = ScanDataLayer_SlideBarcode
NONHIER_0_VAL_3_SECTION = NONHIERLAYER_0_LEVEL_3_SECTION
NONHIER_0_VAL_3_IMAGENUMBER_X = 1
NONHIER_0_VAL_3_IMAGENUMBER_Y = 1

和

[NONHIERLAYER_0_LEVEL_3_SECTION]
BARCODE_IMAGE_TYPE = JPEG
BARCODE_IMAGE_WIDTH = 1782
BARCODE_IMAGE_HEIGHT = 1252