SuperLearner预测误差

Question

我正在使用SuperLearner R包。我正在尝试为训练集和测试集生成预测的y值。

在不定义"newX“的情况下拟合超级学习器模型以首先获得训练集上的预测值，以便我可以计算均方误差和绘制预测值与实际Y值之间的关系之后，我使用”newX“命令通过运行以下代码来预测测试集的Y值：

sl.cv<-SuperLearner(Y = label, X = train, 
                 SL.library=c("SL.randomForest", "SL.glmnet", "SL.svm"),
                 method = "method.NNLS", verbose=TRUE, cvControl=list(V=10))

pred.sl.cv <- predict(sl.cv, newdata=test, onlySL = T)

然后，在“predict”之后，我得到了以下错误："Error in object$whichScreen：$ operator对于原子矢量是无效的“

我浏览了许多在线资源，以了解如何在拟合SuperLearner模型后使用“预测”，我正在做的就像其他人做的那样:即将拟合的SuperLearner模型的对象名称(在本例中为"sl.cv")放在新的测试集之后。我甚至没有输入$ operator。

为什么我会收到这个错误信息？我该如何解决这个问题？

另一个问题是:添加cvControl=list(V=10)选项会有什么变化吗？我认为SuperLearner模型的默认设置是进行10次交叉验证。所以，删除"cvControl=list(V=10)“不会改变任何事情，对吧？

我将非常感谢你的建议。谢谢!

Answer 1

问题是您使用的是训练和/或测试数据的矩阵。您应该使用data.frame。因此，请将您的代码更改为：

sl.cv<-SuperLearner(Y = label, X = as.data.frame(train), 
                 SL.library=c("SL.randomForest", "SL.glmnet", "SL.svm"),
                 method = "method.NNLS", verbose=TRUE, cvControl=list(V=10))

pred.sl.cv <- predict(sl.cv, newdata=as.data.frame(test), onlySL = T)

另外，确保你的标签是一个列表。