不同平台的Networkx图的大小各不相同

Question

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我有一个绘制图形的简短代码：

plt.figure(figsize=(15,15),dpi=300)
ax = plt.subplot(111)
nd = nx.draw_networkx_nodes(G, pos, node_color=node_cols, linewidths=1, node_size=node_sizes)
nd.set_edgecolor('w') #<- set the edgecolor to red on the node markers
nx.draw_networkx_edges(G, pos, edge_color=edge_cols,width=edge_sizes)
nx.draw_networkx_labels(G, pos, labels, font_size=fs, font_weight='bold')
plt.tick_params(
    axis='both',          # changes apply to both axes
    which='both',      # both major and minor ticks are affected
    bottom='off',      # ticks along the bottom edge are off
    top='off',         # ticks along the top edge are off
    labelbottom='off', # labels along the bottom edge are off
    left='off',
    labelleft='off')
#plt.show()
plt.savefig('foo.pdf')

在我的苹果iPython笔记本上运行时，和在微软的pycharm上运行时，尺寸是不同的。有没有办法解决这个问题？如何在知情的情况下指定edge_sizes和node_sizes？谢谢!

Answer 1

jupyter笔记本中matplotlib图形的默认图形大小和dpi不同于通常的脚本。

你可以通过

import matplotlib.pyplot as plt
print(plt.rcParams["figure.figsize"])
print(plt.rcParams["figure.dpi"])

它应该为jupyter笔记本打印[6.0, 4.0] 72.0，为脚本打印[6.4, 4.8] 100.0。

为了设置这些参数，可以使用

plt.rcParams["figure.figsize"] = 6,4
plt.rcParams["figure.dpi"] = 100

将它们设置为所有输出，或者

plt.figure(figsize=(6,4), dpi=100) 

对于一个人来说。这样，您可以确保脚本和notebook的输出是相同的。