pydicom : Dataset没有属性“”TransferSyntaxUID“”

Question

嗨，我正在用pydicom读取DICOM文件

这篇文章不同于pydicom 'Dataset' object has no attribute 'TransferSyntaxUID'

这是我的代码

import dicom
dicom.read_file(file,force=True)

这会导致错误

        AttributeError                            Traceback (most recent call last)
    <ipython-input-32-a32aef2d2178> in <module>()
    ----> 1 dicom.read_file(raw_path + pat_lst[0] + '\\' + pat_dcm_lst[0],force=True)

    D:\Program Files\Anaconda2\lib\site-packages\dicom\filereader.pyc in read_file(fp, defer_size, stop_before_pixels, force)
        612     try:
        613         dataset = read_partial(fp, stop_when, defer_size=defer_size,
    --> 614                                force=force)
        615     finally:
        616         if not caller_owns_file:

    D:\Program Files\Anaconda2\lib\site-packages\dicom\filereader.pyc in read_partial(fileobj, stop_when, defer_size, force)
        520     if preamble:
        521         file_meta_dataset = _read_file_meta_info(fileobj)
    --> 522         transfer_syntax = file_meta_dataset.TransferSyntaxUID
        523         if transfer_syntax == dicom.UID.ImplicitVRLittleEndian:
        524             pass

    D:\Program Files\Anaconda2\lib\site-packages\dicom\dataset.pyc in __getattr__(self, name)
        254         if tag not in self:
        255             raise AttributeError("Dataset does not have attribute "
    --> 256                                  "'{0:s}'.".format(name))
        257         else:  # do have that dicom data_element
        258             return self[tag].value

    AttributeError: Dataset does not have attribute 'TransferSyntaxUID'.

我觉得匿名的时候出了点问题。我想知道为什么会这样。

删除TransferSyntaxUID是否与DICOM标准有关？

而且，我可以通过MATLAB，VTK，ITK阅读，但pydicom

所以现在我要做的是通过SimpleITK手动设置TransferSyntaxUID，然后通过pydicom再次读取。

我会让你知道什么时候管用

提前感谢

Answer 1

pydicom存储库有一个允许缺少传输语法的更新。作为下一版本之前的一种解决办法，您可以修改filereader.py中的几行代码，如下所示的here

Answer 2

根据我对DICOM标准的理解，传输语法UID (0002,0010)似乎是一个强制标签。这是一个指示它为is required的type 1 tag。

虽然这是标准所说的，但即使没有这个标记，库也可能能够读取这样的文件。我猜这是因为标准也定义了default transfer syntax。

关于用SimpleITK设置值，这肯定是可行的。此外，如果需要验证文件是否符合标准，可以使用David Clunie的dicom3tools，特别是dciodvfy和dcdump。