不带X11的Rmarkdown

Question

我尝试在没有启用Rmarkdown的linux机器上运行一个X11脚本(myRmdScript.Rmd)，并且崩溃了，原因是：

Quitting from lines 2-7 (myRmdScript.Rmd)
Error in .External2(C_X11, paste("png::", filename, sep = ""), g$width,  :
  unable to start device PNG
Calls: <Anonymous> ... block_exec -> chunk_device -> dev_new -> do.call -> <Anonymous>
In addition: Warning messages:
1: In grDevices::png(f) : unable to open connection to X11 display ''
2: In (function (filename = "Rplot%03d.png", width = 480, height = 480,  :
  unable to open connection to X11 display ''

Execution halted

这是我的第一个代码块：

```{r setup, include=FALSE}

库(开罗)

knitr::opts_chunk$set(dev="CairoPNG")

knitr::opts_chunk$set(echo=TRUE，out.width='2000px'，dpi=200)

除了在这台机器上启用X11 (这不利于内存消耗问题)之外，还有什么方法可以解决这个问题吗？

Answer 1

最近我也有同样的需求。@hrbmstr在评论中提出的解决方案很接近，但不起作用。

缺少的部分是，您还应该将dev="CairoPNG“添加到setup块中，否则setup块将无法运行。

我的服务器能力，注意jpeg，png，cairo，x11 tiff都是假的：

> capabilities()
       jpeg         png        tiff       tcltk         X11        aqua 
      FALSE       FALSE       FALSE       FALSE       FALSE       FALSE 
   http/ftp     sockets      libxml        fifo      cledit       iconv 
       TRUE        TRUE        TRUE        TRUE        TRUE        TRUE 
        NLS     profmem       cairo         ICU long.double     libcurl 
       TRUE        TRUE       FALSE        TRUE        TRUE        TRUE 

与Cairo包一起编译的完整Rmd。请注意设置块中的dev参数。

---
title: "Untitled"
author: "TC"
date: "12/20/2019"
output: 
    html_document
---

```{r setup, include=FALSE, dev="CairoPNG"}

knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE，dev="CairoPNG")

# test figure

```{r pressure, echo=FALSE}

绘图(压力)

Original discussion