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使用ggplot绘制princomp加载
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Stack Overflow用户
提问于 2017-08-20 01:10:20
回答 1查看 1.9K关注 0票数 2

我正在尝试对我的数据集执行PCA分析,我可以在基本的plot函数上绘制负载。但是我想在ggplot上这样做,但是我一直收到这个错误,"ggplot2不知道如何处理类加载的数据“。

我正在使用princomp函数,并且我正在绘制我的第一个组件和第二个组件。我需要根据一个外部因素对其进行着色,该外部因素具有与我正在执行pca的数据帧相同的行名。我试着用这个Tutorial with prcomp做同样的事情,但是用pca$加载,但是它不起作用。我需要在ggplot中绘制我的第一台PC与第二台PC之间的关系。

区块引用

代码语言:javascript
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xy <- princomp(iris[,-5])
plot(xy$loadings[,"Comp.1"], xy$loadings[,"Comp.2"], col=iris$Species)
ggplot(xy, aes(x=xy$loadings[,1], y=xy$loadings[,2]))+geom_point()
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回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2018-08-11 15:51:22

ggplot(as.data.frame(xy$loadings,1:2),aes(x=Comp.1,y=Comp.2))+geom_point()

票数 1
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原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/45774242

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