Open CV (Python) -脑肿瘤的异常形状斑点检测

Question

我试图在Open CV中使用斑点检测来识别脑瘤，但到目前为止，Open CV只能检测到脑部核磁共振成像中的小圆圈，而不能检测到肿瘤本身。

代码如下：

import cv2
from cv2 import SimpleBlobDetector_create, SimpleBlobDetector_Params
import numpy as np

# Read image
def blobber(filename):
    im = cv2.imread(filename, cv2.IMREAD_GRAYSCALE)

    # Set up the detector with default parameters.
    detector = cv2.SimpleBlobDetector_create()

    params = cv2.SimpleBlobDetector_Params()

    # Filter by Area.
    params.filterByArea = True
    params.minArea = 50

    # Filter by Circularity
    params.filterByCircularity = True
    params.minCircularity = 0

    # Filter by Convexity
    params.filterByConvexity = True
    params.minConvexity = 0.1

    # Create a detector with the parameters
    ver = (cv2.__version__).split('.')
    if int(ver[0]) < 3 :
        detector = cv2.SimpleBlobDetector(params)
    else : 
        detector = cv2.SimpleBlobDetector_create(params)

    # Detect blobs.
    keypoints = detector.detect(im)

    # Draw detected blobs as red circles.
    # cv2.DRAW_MATCHES_FLAGS_DRAW_RICH_KEYPOINTS ensures the size of the circle corresponds to the size of blob
    im_with_keypoints = cv2.drawKeypoints(im,keypoints,np.array([]),(0,0,255),cv2.DRAW_MATCHES_FLAGS_DRAW_RICH_KEYPOINTS)

    # Show keypoints
    cv2.imshow("Keypoints", im_with_keypoints)
    cv2.waitKey(0)

这是当我给程序提供一个黑白对比的大脑图像时会发生的事情(我对大脑进行了对比，以便肿瘤显示为黑色，而大脑的其余部分大部分是白色的)：

无论如何，肿瘤并不是一个完美的圆圈，但它显然是大脑中最大的“斑点”。我怀疑是因为它的外壳是黑色的，内核是白色的，所以Open CV无法识别它。

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只有当我选择一个更容易辨别的肿瘤，没有大的白色内核时，它才能拾取肿瘤。

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有什么建议吗？我需要能够从原始图片中剥离这些斑点(一旦它们能够准确地工作)，并使用它们的关键点从每个切片中的2D肿瘤重建整个大脑中的3D肿瘤。我离这一步还有一段距离，但是这个斑点探测器问题是2D和3D之间的关键纽带。感谢所有的帮助！

Answer 1

可能最大的斑点是头骨本身。如果你分散了最大的斑点的注意力，并保留下一个大的东西，使用轮廓作为外部。