RMySQL系统错误: 10060

Question

我有一个连接在同一设备上正常工作的项目。我突然得到了下面的错误。我可以通过MySQL工作台从同一设备进行连接。

可能的原因是什么？

library(RMySQL)

con <- dbConnect(RMySQL::MySQL(),
                 host = "xxx",
                 dbname="yyy",
                 user = "zzz",
                 password = "############")

Error in .local(drv, ...) : 
  Failed to connect to database: Error: Lost connection to MySQL server at 'reading authorization packet', system error: 10060

这是会话信息

> sessionInfo()
R version 3.3.1 (2016-06-21)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252  LC_CTYPE=English_United States.1252   
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252 LC_NUMERIC=C                          
[5] LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] RMySQL_0.10.10 DBI_0.4-1     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_3.3.1

Answer 1

我的代码在2017年3月29日进行了系统范围的包更新后，自2017年2月1日以来第一次出现了这个确切的问题。

查看RMySQL的版本控制，RMySQL_0.10.9.tar.gz published 2016-05-08 15:39 RMySQL_0.10.10.tar.gz published 2017-03-21 07:50

我将我的版本恢复到0.10.9，问题就消失了：

require(devtools)
install_version("RMySQL", version = "0.10.9", repos = "http://cran.us.r-project.org")

我已将您的问题发布到RMySQL错误页面，因此我们将查看他们是否解决了该问题

Answer 2

我最近检查了另一个最新版本的RMySQL包，RMySQL_0.10.11.zip问题也存在于其中。很抱歉，不能评论，因为目前不允许，因此想要更新关于问题仍然被看到的版本。

与我的系统上的MySQL的其他信息连接是从

1) Cmdline

2) MySQL工作台

3)表格

4) Excel

它在R上不起作用。我检查了以下内容

link1

link2

link3

SHOW GLOBAL STATUS like 'Aborted%clients%';

每次从R中删除连接时，上述变量的值都会变为+1。

SET GLOBAL connect_timeout = 10;

也没帮上忙。

更新

使用RMySQL需要依赖/要求安装PERL吗？到目前为止，我的系统还没有PERL。如果这个要求确实是真的，那么这可能是一个原因，并且可能是最新版本已经解决了这个问题。请让我了解一下PERL依赖项？

Answer 3

我能够在我的PC上使用R3.4修复这个问题，遵循@Page的建议来查看包的版本控制。但是，我不仅需要安装RMySQL的早期版本(从0.10.11恢复到0.10.9)，还需要使用以下命令更改其依赖包DBI的版本(从0.6-1恢复到0.5)：

require(devtools)
install_version("DBI", version = "0.5", repos = "http://cran.us.r-project.org")
install_version("RMySQL", version = "0.10.9", repos = "http://cran.us.r-project.org")