forestplot:我想按照包的建议修改现有的fpDrawNormalCI

Question

振奋人心的例子-我需要做一个森林图与填充和未填充的圆圈的符号。

forestplot(labeltext = labelstrings,
       fn.ci_norm = c(fpDrawCircleCI, fpDrawPointCI),
       mean=cbind(df.both$mauc, df.both$mcmax), 
       lower=cbind(df.both$lauc, df.both$lcmax),
       upper=cbind(df.both$uauc, df.both$ucmax),
       xlog=TRUE,
       boxsize=0.4,
       pch=1,
       xticks = c(0.33,0.5,0.8,1,1.25,2,3),
       col=fpColors(box=c("black","black"),line=c("black","black")),
       txt_gp = fpTxtGp(xlab=gpar(cex=1),ticks=gpar(cex=0.8)))`

但是符号的大小略有不同( fpDrawPointCI比fpDrawCircleCI小)。如果我尝试fpDrawPointCI，我无法获得PCH值的向量来接受。

我试过了

fn.ci_norm = c(fpDrawPointCI(pch=1), fpDrawPointCI(pch=19)

但这并不管用。

因此，在加载库( forestplot )之后，但在forestplot命令之前，我尝试在我的脚本中创建它。

fpDrawPointCIfilled <- function (lower_limit, estimate, upper_limit, size,
    y.offset = 0.5, clr.line, clr.marker, lwd, lty = 1, vertices, 
    vertices.height = 0.1, pch = 16, ...) 
{
    prFpDrawLine(lower_limit = lower_limit, upper_limit = upper_limit, 
        clr.line = clr.line, lwd = lwd, lty = lty, y.offset = y.offset, 
        vertices = vertices, vertices.height = vertices.height)
    box <- convertX(unit(estimate, "native"), "npc", valueOnly = TRUE)
    if (box >= 0 && box <= 1) {
        if (!is.unit(size)) {
        size <- unit(size, "snpc")
    }
    grid.points(x = unit(estimate, "native"), y = unit(y.offset, 
        "npc"), size = size, pch = pch, gp = gpar(fill = clr.marker, 
        col = clr.marker))
}}

它返回一个错误，说明error in fpDrawPointCIfilled()：找不到函数prFpDrawLine。有没有人能提供一个例子，说明他们是如何修改forestplot中的fpDrawNormalCI函数的？

谢谢，克里斯

Answer 1

尝试使用您的初始干净代码并添加以下内容：

meta.ci.pch = 21

(或任何其他代码)来设置点样式的大小和形状。可以使用?points查看所有打印字符的样式。可以在连接列表中设置整个样式列表，该列表的长度与打印数量一样长。只需连接：

meta.ci.pch = c(19, 3, 9)

你最终会得到每一个不同的符号。

我认为你可以使用以下命令来改变圆圈的大小：

circles.cex = 1.1   or   circles.cex = .8

或指示默认大小的110%或默认大小的80%的任何其它数字。但是第一个应该允许你使用中空和填充的形状。

Answer 2

排除您遇到的特定问题的故障是，prFpDrawLine函数不是从forestplot库导出的；它是一个内部函数。一个标准的警告是，未导出的函数可能会在库的未来版本中更改，而不会发出警告。也就是说..。

如果将prFpDrawLine替换为forestplot:::prFpDrawLine，则三重冒号将在库中查找可能导出也可能不导出的对象。在这种情况下，它将找到未导出的函数prFpDrawLine，并且您的代码应该可以工作。

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