Mongodb for HL7-FHIR

Question

学习FHIR并尝试实现使用MongoDb作为数据库的均值堆栈，我想在我的问题上寻求您的帮助。

当我收到一个新资源文档的POST请求时，我会将它插入到MongoDB中。因为MongoDB会将_id (对象id)作为唯一id添加到资源。当我检索文档时，它将有一个额外的字段_id。我认为这将使资源不再合规，因为_id没有在资源中定义。

我可以知道如何处理这个问题吗？这个额外的_id会在冷杉资源中起作用吗？

致以最好的问候，自动运行

Answer 1

因此，我也在使用MongoDB和mongoose在nodejs中实现FHIR。我刚刚在mongoose的模式定义中添加了一个名为id的字段，如下所示

import mongoose from 'mongoose';
import shortid from 'shortid';
class resource extends mongoose.Schema {
  constructor(schema) {
    super();
    this.add({
      // just added this to make MongoDB use shortid
      _id: { type: String, default: shortid.generate },
      id: { type: {} },
      id_: { type: {} },
      implicitRules: { type: String },
      implicitRules_: { type: {} },
      language: { type: String },
      language_: { type: {} },
      ...schema
    });
  }
}
export default resource;

然后，在创建/更新资源时，_id字段从id中获取其值

我用来插入患者资源的代码

upsert(root, params, context, ast) {
    const projection = this.getProjection(ast);
    if (!params.data.id) {
      params.data.id = shortid.generate();
    }
    params.data.resourceType = 'Patient';
    const upserted = model
      .findByIdAndUpdate(params.data.id, params.data, {
        new: true,
        upsert: true,
        select: projection
      })
      .exec();

    if (!upserted) {
      throw new Error('Error upserting');
    }
    return upserted;
  }

Answer 2

是的，_id将不符合。你不能把它改成“id”吗？

Answer 3

也许您可以看看Spark server，它也使用MongoDB来存储资源。在Spark.Store.Mongo命名空间中，您将看到一些助手方法，用于将Mongo BSONdocument转换为FHIR资源。