读取R (ncdf4包)中的.nc4文件时出错

Question

我正在尝试使用从NASA下载的.nc4 files数据集。

this source确认了NCDF4格式。我在R中使用download .file来获取数据库，然后使用一个简单的nc_open (ncdf4包)来测试文件。不幸的是，结果是一个“未知的文件格式”错误。

下面是我的replication file和脚本：

download.file (url=http://hydro1.gesdisc.eosdis.nasa.gov/.../url, destfile=destination_folder/file.nc4)

到目前为止一切都很好，但是在测试文件时：

library(ncdf4)
setwd('destination_folder')
data <- nc_open('file.nc4')
Error in R_nc4_open: NetCDF: Unknown file format
 Error in nc_open("file.nc4") : 
 Error in nc_open trying to open file file.nc4

我是不是遗漏了什么？

谢谢。

Answer 1

我不知道哪里出了问题，但我可以补充说，问题存在于ncdf4包的Windows实现中。使用以下语句：

catlg<-nc_open("http://opendap.deltares.nl/thredds/dodsC/opendap/rijkswaterstaat/waterbase/concentration_of_suspended_matter_in_water/catalog.nc")

我有与问题中描述的相同的问题。然而，它在Linux下的R中工作得很好

文件服务器是严格遵循netcdf4约定的OpenDAP服务器，但是在Windows下的ncdf4包中可能没有正确实现某些功能

Answer 2

由于某种原因，我在使用64位C:\Program Files\R\R-3.4.2)时得到相同的错误，但在使用64位C:\Program Files\R\R-3.3.3时，ncdf4包工作正常。

这并不能解决问题，但它暂时提供了一种简单的解决方法。