远程3D和4D变量的NcML聚合？

Question

NcML可以用来聚合3D和4D网格吗？我不确定，因为它们在维度的数量上不同。例如，海面高度( ssh )和水温，其中ssh具有三维时间，纬度，经度，温度具有四个维度时间，深度，纬度，经度？我的测试没有成功，所以我的直觉是我必须将3D和4D变量分解成单独的目录。但我希望其他人能有其他的建议？

虽然我尝试使用以下代码片段的“联合”聚合，但时间维度没有得到适当的映射，因为3D变量从2008-12-28开始，4D变量从2008-05-08开始：

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<netcdf xmlns="http://www.unidata.ucar.edu/namespaces/netcdf/ncml-2.2">
  <attribute name="title" value="HYCOM test aggregation #1"/>
  <aggregation type="union">
    <!-- These are the 3D variables: -->
    <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycom2d"/>
    <!-- These are the 4D variables: -->
    <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomT"/>
    <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomS"/>
    <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomU"/>
    <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomV"/> 
  </aggregation>
</netcdf>

然后我在"time“维度上尝试了一个"joinExisting”聚合，但只有在每个数据集都包含相同的变量时才有效(实际上并不是这样)。根据我在聚合中首先列出的数据集，在下面的示例中排除3D或4D变量：

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<netcdf xmlns="http://www.unidata.ucar.edu/namespaces/netcdf/ncml-2.2">
  <attribute name="title" value="HYCOM test aggregation #2"/>
  <aggregation dimName="time" type="joinExisting">
    <!-- These are the 3D variables: -->
    <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycom2d"/>
    <!-- These are the 4D variables: -->
    <aggregation type="union">
      <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomT"/>
      <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomS"/>
      <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomU"/>
      <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomV"/> 
    </aggregation>
  </aggregation>
</netcdf>

那么，有没有办法聚合这些数据集？我必须将3D和4D变量分开吗？

感谢夏威夷大学马诺阿分校的约翰·毛雷尔太平洋岛屿海洋观测系统(PacIOOS)

Answer 1

约翰

由于要加入的文件具有不同的时间坐标，但具有相同的名称，因此需要重命名其中一个文件。我本以为这个简单的NcML会起作用，只需在3D数据中重命名时间维度和时间变量的维度和名称

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<netcdf xmlns="http://www.unidata.ucar.edu/namespaces/netcdf/ncml-2.2">
    <attribute name="title" value="HYCOM test aggregation #1"/>
    <aggregation type="union">
        <!-- These are the 3D variables: -->
        <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycom2d">
            <dimension name="time2d" orgName="time"/>
            <variable name="time2d" orgName="time"/>
        </netcdf>
        <!-- These are the 4D variables: -->
        <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomT"/>
        <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomS"/>
        <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomU"/>
        <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomV"/> 
    </aggregation>
</netcdf>

但它没有，因为不知何故，NetCDF-Java似乎在我们更改变量和维度名称之前添加了一个带有"time lon lat“值的属性_CoordinateAxes。因此，如果我们从3D数据中删除该属性，它就会起作用：

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<netcdf xmlns="http://www.unidata.ucar.edu/namespaces/netcdf/ncml-2.2">
    <attribute name="title" value="HYCOM test aggregation #1"/>
    <aggregation type="union">
        <!-- These are the 3D variables: -->
        <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycom2d">
            <dimension name="time2d" orgName="time"/>
            <variable name="time2d" orgName="time"/>
            <variable name="qtot">
                <remove type="attribute" name="_CoordinateAxes"/>
            </variable>
            <variable name="emp">
                <remove type="attribute" name="_CoordinateAxes"/>
            </variable>
            <variable name="t_trend">
                <remove type="attribute" name="_CoordinateAxes"/>
            </variable>
            <variable name="s_trend">
                <remove type="attribute" name="_CoordinateAxes"/>
            </variable>
            <variable name="ssh">
                <remove type="attribute" name="_CoordinateAxes"/>
            </variable>
            <variable name="mld">
                 <remove type="attribute" name="_CoordinateAxes"/>
            </variable>
            <variable name="mlp">
                 <remove type="attribute" name="_CoordinateAxes"/>
            </variable>
        </netcdf>
        <!-- These are the 4D variables: -->
        <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomT"/>
        <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomS"/>
        <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomU"/>
        <netcdf location="dods://apdrc.soest.hawaii.edu:80/dods/public_data/Model_output/HYCOM/global/hycomV"/> 
    </aggregation>
</netcdf>

这是来自ToolsUI的结果数据集的屏幕截图，其中您可以看到3D和4D变量：

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