问Bioperl和Samtools
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Stack Overflow用户

提问于 2013-04-01 15:41:35

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如何使用Bioperl运行'mpileup‘？

当尝试使用Bio::Tools:: run ::Samtools运行mpileup时，我发现'mpileup‘没有注册。我做错了什么？任何指向正确方向的指示都将受到感谢。谢谢你们……

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发布于 2013-04-01 22:18:49

简而言之，您不能使用BioPerl-Run运行mpileup，因为正如您的错误消息所描述的那样，该命令似乎没有被列为samtools可用的命令。您可能希望在bioperl-listserv上提出此问题，并希望有人会添加此功能。

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/15739579

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