如何使用mlabwrap从python中调用带单元格参数的matlab函数？

Question

嗯，我为自己正确安装了mlabwrap而感到自豪，但现在我不能让它与matlab单元一起工作。在python中，列表类似于单元格，所以我想我应该输入一个列表，然后mlabwrap会将它转换成一个单元格。不幸的是，它似乎不是这样工作的。

例如，我有一个matlab m文件：

function list_test(x)
display(x);

在python中，如果我键入

mlab.list_test([[1,2],[3,4]])

我得到了：

x =

1     2
3     4

因此，mlabwrap似乎将我的两个嵌套列表转换成一个2x2矩阵，这并不是我想要的。

当我尝试的时候

mlab.list_test([[1,2],[3,4,5]]) 

然后我得到：

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/Users/Ben/.virtualenvs/test/lib/python2.7/site-packages/mlabwrap.py", line 607, in mlab_command
    return self._do(name, *args, **update({'nout':nout}, kwargs))
  File "/Users/Ben/.virtualenvs/test/lib/python2.7/site-packages/mlabwrap.py", line 534, in _do
    mlabraw.put(self._session,  argnames[-1], arg)
TypeError: a float is required

显然没有骰子。

如果有必要，我想我可以编写一些python代码将列表转换为几个一维数组，使用mlabwrap将一维数组提供给matlab，并编写一些matlab代码将这些一维数组转换为单元格。但这很混乱，我想知道是否有更简单的方法。mlabwrap能为我做这件事吗？

以下是我的设置的详细信息。操作系统: Mountain Lion (OS X 10.8)，Python: 2.7，Matlab: 2010b，mlabwrap: 1.1

Answer 1

不幸的是，mlabwrap对单元数组的支持有限；无论是在将单元数组传递到matlab时，还是在从matlab接收单元数组时。

下面是你直接提出的问题的答案：

>>> from mlabwrap import mlab as matlab

>>> a = [[1, 2], [3, 4]]
>>> cell = matlab.mat2cell(array(a), [1, 1], [2])
>>> matlab.display(cell)

PROXY_VAL2__ = 

    [1x2 double]
    [1x2 double]

请注意，这实际上只适用于规则大小的列表。即[1,2,3,4]起作用，但[1,2,3,4,5]不起作用。这是因为dtype=float不能很好地处理mlabwrap数组，而是需要mlabwrap数组。

让我们切换到matlab来进行快速比较：

>> display(cell)

cell = 

    [1x2 double]    [1x2 double]

看起来不错！但是，当我们切换回python，并尝试实际访问我们创建的cell数组时：

>>> cell[0][0]

error: Unable to get matrix from MATLAB(TM) workspace

>>> cell[0, 0]

error: Unsupported index type: <type 'tuple'>

>>> type(cell)
mlabwrap.MlabObjectProxy

不幸的是，mlabwrap实际上并不允许访问存储在MlabObjectProxy对象中的数据。有几种方法可以尝试解决这个问题。您可以在matlab中编写cell_insert和cell_pop函数。这些应该使您能够将python变量放入现有的单元数组中，并从单元数组中获得python可读的变量。或者，您可以将单元格数组从matlab写入.mat文件，然后使用scipy.io.loadmat()将其读取到python中。

老实说，除非您出于某种原因绝对需要单元数组，否则我会尽量避免通过mlabwrap使用它们。

Answer 2

如果有人在几年后读到这篇文章，实际上已经有了对单元格数组和字符数组的基本支持，您只需键入以下内容：

mlab._dont_proxy["cell"] = True

在使用返回单元格或字符数组的matlab命令之前。这是在https://github.com/aweinstein/mlabwrap和https://github.com/cpbotha/mlabwrap-purepy上测试的