使用pandas，Python3(而不是2)读取h5文件时出现“已感知tz”错误

Question

我有一个名为weather.h5的h5商店。我的默认Python环境是3.5.2。当我尝试阅读这个商店时，我得到的是TypeError: Already tz-aware, use tz_convert to convert。

我已经尝试了pd.read_hdf('weather.h5','weather_history')和pd.io.pytables.HDFStore('weather.h5')['weather_history]，但无论如何我都会遇到错误。

Answer 1

我也有同样的问题。我使用的是Anaconda Python: 3.4.5和2.7.3。两者都使用pandas 0.18.1。

下面是一个可重复使用的示例：

generate.py (使用Python2执行)：

import pandas as pd
from pandas import HDFStore

index = pd.DatetimeIndex(['2017-06-20 06:00:06.984630-05:00', '2017-06-20 06:03:01.042616-05:00'], dtype='datetime64[ns, CST6CDT]', freq=None)
p1 = [0, 1]
p2 = [0, 2]

# Saving any of these dataframes cause issues
df1 = pd.DataFrame({"p1":p1, "p2":p2}, index=index)
df2 = pd.DataFrame({"p1":p1, "p2":p2, "i":index})

store = HDFStore("./test_issue.h5")
store['df'] = df1
#store['df'] = df2
store.close()

read_issue.py：

import pandas as pd
from pandas import HDFStore

store = HDFStore("./test_issue.h5", mode="r")
df = store['/df']
store.close()

print(df)

在Python2中运行read_issue.py没有问题，并生成以下输出：

p1 p2

2017-06-20 11:00:06.984630-05:00 0 2017-06-20 11:03:01.042616-05:00 1 2

但在Python3中运行它会产生错误，并显示以下回溯：

回溯(最近一次调用)：df =

‘df’文件"/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py"，行417中的文件"read_issue.py"，行5，getitem return self.get(key)文件key行634，在get return self._read_group(组)文件"/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py"，行1272中，在_read_group return s.read(**kwargs)文件"/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py"，行2779中，在读取ax = "/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py"，(‘轴%d’% i)文件索引行2367中，在read_index _中，索引= self.read_index_node(getattr(self.group，key))文件索引行2492，在新的"/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/indexes/base.py"，(data，kind，encoding=self.encoding)文件“/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/indexes/base.py”，行153，在新的结果=encoding=self.encoding(data，copy=copy，name=name，**kwargs)文件kwargs行91，在wrapper return func(*args，**kwargs)文件的第321行中，在new raise TypeError(“已经知道tz，使用tz_convert”TypeError:已经知道tz，使用tz_convert进行转换。正在关闭其余打开的文件：./test_Ise.h5...已完成

因此，指数存在一个问题。但是，如果将df2保存在generate.py中(datetime作为列，而不是索引)，则Python3在read_issue.py中会产生不同的错误：

回溯(最近一次调用)：文件"read_issue.py"，行5，在df =

‘/df’文件"/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py"，行417，在getitem return self.get(key)文件"/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py"，行634，在get return self._read_group(组)文件"/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py"，行1272中，在_read_group return s.read(**kwargs)文件"/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/io/pytables.py"，行2788中，在读取值(Blk_items)文件"/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/core/internals.py"，行2518，在make_block return klass(values，ndim=ndim，fastpath=fastpath，placement=placement)文件"/home/denper/anaconda3/envs/py34/lib/python3.4/site-packages/pandas/core/internals.py"，行90，in init len(self.mgr_locs)) ValueError:传递的项目数错误2，位置意味着1关闭剩余打开的文件：./ValueError_Ise.h5...完成