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社区首页 >问答首页 >R2WinBUGS错误-陷阱-不兼容的拷贝

R2WinBUGS错误-陷阱-不兼容的拷贝
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Stack Overflow用户
提问于 2013-01-30 11:42:41
回答 1查看 3.9K关注 0票数 2

我尝试从R调用winBUGS来估计逻辑回归。我使用了以下代码:

代码语言:javascript
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# Directorio de trabajo
setwd("~/3 Diplomado/7 Bayesiana/8t1")

# paquete para hablarse con WinBUGS desde R
library(R2WinBUGS)

# cargamos datos
reg <- read.table("enf.csv", header = TRUE, sep = ",")
edad <- reg$edad
enfer <- reg$efer
n <- length(reg$edad)

# Primeras filas de los datos
head(reg)

# Nombres de los datos para alimentar al modelo en WinBUGS
datos <- list("edad","enfer", "n")

# Construimos el modelo

modelo <- function(){
  for (i in 1:n) {
    enfer[i] ~ dbin(theta[i], 1)
    logit(theta[i]) < - beta0 + beta1 * edad[i] 
    phi[i]<-theta[i]/(1-theta[i])
      }
  beta0 ~ dnorm(0, 0.0001)
  beta1 ~ dnorm(0, 0.0001)

}

## escribimos el modelo a un archivo .bug file:
write.model(modelo, "modelo.bug")
## Para echarle un vistazo al modelo:
file.show("modelo.bug")

# Distribuciones iniciales
iniciales <- function(){
 list(beta0=1,beta1=1)
}

# Corremos esto en WinBUGS

   regresionlogistica.sim = bugs(datos,iniciales,
                 model.file="modelo.bug",
                 parameters=c("beta0","beta1"),
                 n.chains=1,n.iter=20000,n.burnin=5000,n.thin=1,
                 bugs.directory="C:/Users/pythonxy/Documents/3 Diplomado/7 Bayesiana/winbugs14",
                 working.directory="~/3 Diplomado/7 Bayesiana/8t1",          
                 codaPkg=FALSE)

WinBUGS打开,但我得到一个错误。“不兼容的副本”。我一直在寻找这个错误,发现很多人都经历过这个错误。我已经尝试了建议的解决方案:缩短model.bug的文件路径,确保工作目录中没有更多的“数据”文件,使用数据变量名称的列表,等等。

但我还是不能让它工作。我做错了什么?

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回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2013-01-31 21:47:39

如果我没记错的话,如果输入数据或输出参数有问题,就会出现这个错误。我在你的代码中发现了几个潜在的问题:

  1. 我认为这个datos <- list("edad","enfer", "n")是错误的:你应该使用like datos <- list(edad = edad, enfer = enfer, n = n),因为你想传递实际的数据,而不仅仅是R变量名!不要将此与计算但不监视的输出parameters!
  2. phi节点相混淆。我不确定这是否会是一个问题,但WinBUGS有时会以这种方式表现得很奇怪。
  3. 初始值应该是随机生成的,而不是像这样固定的(如rnorm(1, 0, 0.01)等)
票数 5
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/14596307

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