R:文件出错(dyn.load，DLLpath = DLLpath，...)

Question

我现在已经在我办公室的台式电脑上做了一段时间的R项目了，但我需要在旅行时随身携带脚本。我将所有内容复制到我的笔记本电脑中，并对代码进行了一些更改。遗憾的是，在尝试编译(按照我在台式计算机上使用的完全相同的过程)时，出现了以下错误：

$ R CMD INSTALL --no-multiarch --with-keep.source coala
* installing to library ‘/home/my_pc/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3’
* installing *source* package ‘coala’ ...
** libs
make: Nothing to be done for `all'.
installing to /home/my_pc/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/coala/libs
** R
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
** testing if installed package can be loaded
Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : 
unable to load shared object '/home/my_pc/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/coala/libs/coala.so':
/home/my_pc/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/coala/libs/coala.so: undefined symbol: _ZSt24__throw_out_of_range_fmtPKcz
Error: loading failed
Execution halted
ERROR: loading failed
* removing ‘/home/my_pc/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/coala’
* restoring previous ‘/home/my_pc/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/coala’

这两台电脑都有相同的Ubuntu，但R版本不同。另外，我必须提到我同时在两个库中工作，并且随附的库更新没有问题，这使得这个错误消息更加令人费解。我已经检查了可能与这个问题相关的答案，但不知道如何应用他们的解决方案：

R: error installing packages UBUNTU - Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : unable to load shared object Got message unable to load shared object stats.so when R starts

有没有办法解决这个问题？可能的原因是什么？什么是未定义的符号_ZSt24__throw_out_of_range_fmtPKcz

Answer 1

我在Ubuntu上的rgdal也遇到了类似的问题。重新安装软件包就足以让它再次工作。

$ sudo R
> install.packages("rgdal")
> quit()
$ exit

Answer 2

.libPaths()为您提供了什么作为输出？

我今天使用最新的更新(适用于MacOS X的R 3.3.1 )遇到了同样的问题。我的R安装在更新后似乎崩溃了。我的解决方案是简单地从文件系统中删除lib目录并重新安装R：

rm -rf /Users/johann/Library/R/3.3/library
sudo rm -rf Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.3/Resources/library

希望这能帮到你。

Answer 3

问题是与您的g++标准库的链接。不同版本的Ubuntu有不同版本的g++ stdlib。你不能总是把二进制文件从一个拷贝到另一个。

您可以通过重新编译笔记本电脑的R或使用Ubuntu R包来修复此问题。例如http://packages.ubuntu.com/xenial/r-base