LSF平台错误: lsb_init:调用LSF库失败:无法打开文件lsf.conf

Question

我有一个关于LSF平台的问题，我不能完全理解。

出于脚本编写的原因，我需要使用perl脚本检查带有‘bjob’(和其他b*)的正在运行/挂起的作业。

由于某些原因，它无法工作，并且我能够查看以下错误消息：

lsb_init: Failed in an LSF library call: Unable to open file lsf.conf

我在Google上做了一些研究，在手册中没有给出很好的结果，我做了一个小测试。

我的帐户(max)是LSF管理员。Root也是LSF管理员。

所以我切换到根目录，并尝试启动bjob，但使用'sudo -u max‘是最大的。请看下面的命令：

hn[~]=> whoami
max
hn[~]=> bjobs
No unfinished job found
hn[~]=> su
Password: 
[root@hn max]# whoami
root
[root@hn max]# sudo -u max whoami
max
[root@hn max]# bjobs
No unfinished job found
[root@hn max]# sudo -u max bjobs
lsb_init: Failed in an LSF library call: Unable to open file lsf.conf

我怎样才能纠正这个错误呢？

Answer 1

默认情况下，LSF会在/etc中查找lsf.conf，如果不在那里，则会在环境变量LSF_ENVDIR中的目录中查找。

sudo可能正在重置您的环境。尝试sudo -i或put

Defaults !env_reset

在你的sudoers文件里。

您也可以尝试下面这样的方法

sudo -u max LSF_ENVDIR=$LSF_ENVDIR LSF_SERVERDIR=$LSF_SERVERDIR bjobs

Answer 2

对于使用SSH编写脚本的任何人，必须在命令行上显式设置上述两个变量，如下所示：

ssh foo@bar.net 'export LSF_ENVDIR=/path/to/lsf/envdir; export LSF_SERVERDIR=/path/to/lsf/serverdir; bsub ...'

或者在文件sshd文件中(假设sshd配置了PermitUserEnvironment yes)。