我在做流式细胞术。我想使用python解析.fcs文件。我在互联网上研究过,有一个fcm模块,但它是为linux操作系统设计的,我正在windows上工作。
我想知道如何使用python在windows中解析.fcs文件?
如果有人知道如何在windows中使用fcm,也请让我知道。
发布于 2012-12-08 13:46:42
Pyfcm可以在Windows上工作。有关加载fcs文件的教程,请参阅http://packages.python.org/fcm/basic.html。安装程序位于http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#py-fcm
发布于 2012-12-08 12:21:51
查看FlowPy。其download page上列出的前提条件都指向Windows二进制文件。似乎是一个不错的FCS GUI (甚至是非GUI)项目。
发布于 2014-06-06 22:41:14
另一个用于分析流式细胞仪数据的python项目是FlowCytometryTools:http://gorelab.bitbucket.org/flowcytometrytools/
在python设置了所需的依赖项(matplotlib、pandas等)之后,这应该可以在任何操作系统上运行。
https://stackoverflow.com/questions/13774315
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