Bash -迭代复制文件

Question

我想将一个名为dti_fin_fa的文件列表从一个文件夹复制到另一个文件夹。

这些文件分散在不同的文件夹中。

   Controls

   └───C01
   │   └───difusion 
   │       └───Deterministic
   │             └───dti_fin_fa.nii
   └───C02
   │   └───difusion 
   │       └───Deterministic
   │             └───dti_fin_fa.nii
   └───C03
   │   └───difusion 
   │       └───Deterministic
   │             └───dti_fin_fa.nii

我想选择并复制所有的dti_fin_fa，保留文件夹结构，因此，在我的新目录中，我将拥有上面看到的文件夹分布。问题是，在这个文件夹中(deterministic，difusion等)，有很多其他我不想复制的文件，所以我不能只复制主文件夹(C01等)

这就是我所拥有的：

#!/bin/bash
DIR="/media/Batty/Analysis"; cd "$DIR" || exit
for group in Controls; do
    for folder in $group/*; do
        for dti in $folder/difussion/Deterministic/dti_fin_fa.nii; do
        echo $dti
        cp $dti /media/Roy/Analysis/Controls/ --verbose
        done;
    done;
done;

问题是，这段代码将每个dti_fin_fa.nii图像复制到/media/Roy/Analysis/Controls/中，因此只保留最后一个，而不是创建所有其他子文件夹。

这样的东西能行得通吗？

cp $folder/difusion/Deterministic/$dti /media/Roy/Analysis/Patients/ --verbose

Answer 1

遍历每个控件，创建等效的目录，然后只复制所需的文件：

for group in "Control"/* "Patients"/*; do
  orig="$group/difusion/Deterministic"
  dest="/media/Roy/Analysis/Controls/$(dirname group)/$orig" 
  mkdir -p "$dest"
  cp "$orig/dti_fin_fa.nii" "$dest/" 
done

我假设您是从示例的DIR目录执行此命令的。因此，这里的orig是图像文件夹的相对路径，dest是目标目录的绝对路径，包括保留的原始文件夹结构。mkdir -p确保这样的结束目录存在，最后复制镜像。