用RStudio 0.99.902编译遗留的Sweave

Question

我对自2009年以来一直在CRAN上的“sos”包中的“sos”vignette有很多问题。我最近注意到它在很多方面都失败了，我不知道如何修复其中的几个问题。在MacOSX10.11.5下，用R 3.3.0在RStudio中的“sos.Rnw”上编译PDF产生了如下的XQuartz弹出窗口：

>Sweave Noweb Syntax?
>>It seems you are using the Sweave-specific syntax in line(s) 
>>9, 15, <snip>;  you may need Sweave2knitr("sos.Rnw") to 
>>convert it to knitr'.  

按照它的要求，我执行了以下操作：

Sweave2knitr('sos.Rnw')

这产生了一个文件‘sos-netr.Rnw’。我在RStudio中打开了这个文件，然后点击了“编译PDF”。我只有一句话：

>Loading required package: knitr" 

如果我还有其他东西，我不知道它去哪了。

有什么建议可以帮我度过这个难关吗？

谢谢，斯宾塞·格雷夫斯

Answer 1

默认情况下，RStudio使用knitr而不是sweave生成代码。通过执行以下操作来恢复此决定：

RStudio：

工具->全局选项-> ->编织Rnw文件使用：Sweave