用rootpy和matplotlib绘制二维直方图

Question

我正在尝试用rootpy和matplotlib绘制一个根2D直方图。

我使用的代码是：

from rootpy.io import File
from rootpy.plotting import Hist
import rootpy.plotting.root2matplotlib as rplt
import matplotlib.pyplot as plt
inputFile = File('mydata.root', 'read')
h_response = inputFile.myfolder.response

plt.figure(figsize=(16, 10), dpi=100)
rplt.hist(h_response, label='response matrix')
h_response.Draw()
plt.xlabel('reconstructed $E_{\mathrm{T}}^{miss}$')
plt.ylabel('Generated $E_{\mathrm{T}}^{miss}$')
plt.title('Response Matrix')
plt.savefig('ResponseMatrix.png')

然而，这给我留下了错误msg：

Traceback (most recent call last):
  File "/storage/Dropbox/Workspace/Analysis/DailyPythonScripts/src/unfolding.py", line 66, in <module>
    rplt.hist(h_response, label='response matrix')
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/rootpy-0.7.0_a0-py2.7-linux-x86_64.egg/rootpy/plotting/root2matplotlib.py", line 140, in hist
    snap_zero=snap_zero)
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/rootpy-0.7.0_a0-py2.7-linux-x86_64.egg/rootpy/plotting/root2matplotlib.py", line 82, in _set_bounds
    ywidth = ymax - ymin
TypeError: unsupported operand type(s) for -: 'list' and 'list'

显然我用错了rootpy2matplotlib模块，所以我看了一下:这个模块提供了: hist，bar和errorbar函数--没有专门针对>= 2D的。

我是不是遗漏了什么？有没有简单的变通方法？

PS:我想用一个“rootpy”标签来标记这个问题，但这是不可能的。所以我很抱歉，因为这个问题很具体。

Answer 1

rootpy的root2matplotlib界面现在提供了用于绘制2D根直方图的hist2d、imshow和轮廓函数。请参阅此处的示例：

https://github.com/rootpy/rootpy/blob/master/examples/plotting/plot_matplotlib_hist2d.py

from matplotlib import pyplot as plt
from rootpy.plotting import root2matplotlib as rplt
from rootpy.plotting import Hist2D
import numpy as np

a = Hist2D(100, -3, 3, 100, 0, 6)
a.fill_array(np.random.multivariate_normal(
    mean=(0, 3),
    cov=np.arange(4).reshape(2, 2),
    size=(1E6,)))

fig, (ax1, ax2, ax3) = plt.subplots(nrows=1, ncols=3, figsize=(15, 5))

ax1.set_title('hist2d')
rplt.hist2d(a, axes=ax1)

ax2.set_title('imshow')
im = rplt.imshow(a, axes=ax2)

ax3.set_title('contour')
rplt.contour(a, axes=ax3)

fig.subplots_adjust(right=0.8)
cbar_ax = fig.add_axes([0.85, 0.15, 0.05, 0.7])
fig.colorbar(im, cax=cbar_ax)

plt.show()

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Answer 2

我刚刚在一个包含TH2D直方图的根文件上测试了您的脚本。一切都成功了。

/opt/rootpy # cat version.txt给我: 0.7.0

如果我检查我的

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/rootpy-dev-py2.7.egg/rootpy/plotting/root2matplotlib.py

并将其与您得到的错误消息进行比较，那么看起来我们使用的是不同版本的rootpy。

尝试最新版本的rootpy。