pystan .plot()两次绘制跟踪摘要

Question

这可能是一个愚蠢的问题，但是每当我使用.plot()函数时，它都会绘制两次摘要。谁知道，为什么它会这样做，我怎么才能阻止它？

​

如你所见，我正在使用jupyter笔记本。

任何stan模型都会发生这种情况(并且在两个单独的安装上)

这段代码将为我产生问题

import pystan 
import numpy as np
model_string = """
data { 
    int<lower=0> N;
    int y[N]; 
}
parameters {
    real<lower=0, upper=1> theta;
}
model {
    theta ~ beta(1,1);
    y ~ bernoulli(theta);
}
"""
N = 50
z = 10
y = np.append(np.repeat(1, z), np.repeat(0, N - z))
dat = {'y':y,
      'N':N}

fit = pystan.stan(model_code=model_string, data=dat, iter=1000, warmup=200, thin=1, chains = 3)
fit.plot()

Answer 1

这是由于%matplotlib inline语句绘制的内容比您希望的要多。StanFit4Model.plot方法调用matplotlib.pyplot.subplot，当您的笔记本有%matplotlib inline时，该调用本身将绘制一个图。然后该方法返回Figure对象。如果您没有捕捉到它，您的笔记本决定将其显示为图像，而不是打印文字，您将得到双倍图。

您可以通过捕获输出Figure来输出单个绘图。更改您的代码

fit.plot()

取而代之

fig = fit.plot()

Answer 2

在`.plot()‘后面加一个分号也可以解决这个问题。

从https://github.com/stan-dev/pystan/issues/230那里学到的