使用as.factor()时获取<NA>

Question

我正在尝试将data.frame列的每个值转换为因子，这样我就可以将它们用作箱线图中的“组”。但是，同时使用as.factor()和as.factor()函数，它会将每个值转换为。该列中有5种不同的单元格类型，CD8，CD4，Bcell，Mono，Gran -并且都变成NA。

令人困惑的是，当我仅将该函数应用于列的一行时，它工作得非常好。数据帧非常非常大(超过300万行)-这会是问题的原因吗？

代码：

> head(BP)
 Methylation Cell_Type
  1  0.03219298       CD8
  2  0.11684228       CD8
  3  0.04214158       CD8
  4  0.26700497       CD8
  5  0.34251732       CD8
  6  0.34231208       CD8

> BP$Cell_Type <- as.factor(BP$Cell_Type)

  > head(BP)
     Methylation Cell_Type
   1  0.03219298      <NA>
   2  0.11684228      <NA>
   3  0.04214158      <NA>
   4  0.26700497      <NA>
   5  0.34251732      <NA>
   6  0.34231208      <NA>

不确定为什么会发生这种情况--任何建议都会非常感谢！

谢谢

输出数据输出(头(BP))

> dput(head(BP))
 structure(list(Methylation = c(0.0321929818018839, 
 0.116842281589967, 
 0.0421415803696093, 0.267004971824527, 0.342517319094108, 
 0.342312083101948
 ), Cell_Type = structure(list(Cell_Type = structure(c(3L, 3L, 
 3L, 3L, 3L, 3L), .Label = c("Bcell", "CD4", "CD8", "Gran", "Mono"
 ), class = "factor")), row.names = c(NA, 6L), class = 
 "data.frame")), row.names = c(NA, 
 6L), class = "data.frame")

Answer 1

也许首先要确保Cell_Type是一个角色？

BP <- tibble::tribble(
     ~Methylation, ~Cell_Type,
  0.03219298,  "CD8",
  0.11684228,  "CD8",
  0.04214158,  "CD8",
  0.26700497,  "CD8",
  0.34251732,  "CD8",
  0.34231208,  "CD8")

BP$Cell_Type <- as.factor(BP$Cell_Type)  


print(BP)

Methylation Cell_Type
        <dbl> <fct>    
1      0.0322 CD8      
2      0.117  CD8      
3      0.0421 CD8      
4      0.267  CD8      
5      0.343  CD8      
6      0.342  CD8   

或者简单地说

BP$Cell_Type <- as.factor(as.character(BP$Cell_Type))