我可以指定哪台主机在MPI程序中具有哪个等级吗？

Question

我正在使用MPI在异构计算系统上执行并行作业。我的网络中的节点并不完全相同。

我想指定机器'A.univ.edu‘的等级为0，机器'B.univ.edu’的等级为1。

有没有办法指定如何在MPI中为主机分配等级？

Answer 1

看起来至少OpenMPI允许您指定一个rankfile

上面的例子如下

rankfile.txt:
rank 0=A.univ.edu slot=0
rank 1=B.univ.edu slot=0

mpiexec -np 2 -H A.univ.edu,B.univ.edu -rf rankfile.txt executable.exe

http://mirror.its.dal.ca/openmpi/doc/v1.5/man1/mpiexec.1.php#sect9

Answer 2

如果所有其他方法都失败了，您始终可以使用MPI_Comm_split创建一个新的通信器，在该通信器中，您的所有进程都具有所需的等级。在每个进程确定其预期的等级(例如，存储在newRank中)之后，对MPI_Comm_split(MPI_COMM_WORLD, 0, newRank, newComm)的调用将在newComm中创建一个具有正确顺序的通信器。然后，您可以在所有通信调用中使用该通信器而不是MPI_COMM_WORLD。

Answer 3

您可以使用"-rank-by node“开关。这将导致以指定主机的顺序映射进程。