更新现有Rdata文件

Question

我发现自己需要更新之前使用save创建的Rdata文件中的一个或两个数据对象。如果我不小心加载文件，我可能会忘记重新保存文件中的一些对象。例如，我正在处理一个包，其中的一些对象存储在sysdata.rda (供内部使用的查找表，我不想导出)中，并且只想考虑更新单个对象。

我还没有弄清楚是否有一种标准的方法来做到这一点，所以我创建了自己的函数。

resave <- function (..., list = character(), file = stop("'file' must be specified")) {
  # create a staging environment to load the existing R objects
  stage <- new.env()
  load(file, envir=stage)
  # get the list of objects to be "resaved"
  names <- as.character(substitute(list(...)))[-1L]
  list <- c(list, names)
  # copy the objects to the staging environment
  lapply(list, function(obj) assign(obj, get(obj), stage))
  # save everything in the staging environment
  save(list=ls(stage, all.names=TRUE), file=file)
}

不过，这看起来有点过头了。有没有更好/更简单的方法来做到这一点？

顺便说一句，我假设在函数的作用域中创建的新环境在函数调用后被销毁，这是正确的吗？

Answer 1

以下是一个略短的版本：

resave <- function(..., list = character(), file) {
   previous  <- load(file)
   var.names <- c(list, as.character(substitute(list(...)))[-1L])
   for (var in var.names) assign(var, get(var, envir = parent.frame()))
   save(list = unique(c(previous, var.names)), file = file)
}

我利用了load函数返回已加载变量的名称这一事实，因此我可以使用该函数的环境，而不是创建一个。在使用get时，我非常小心地只查看调用函数的环境，即parent.frame()。

这是一个模拟：

x1 <- 1
x2 <- 2
x3 <- 3
save(x1, x2, x3, file = "abc.RData")

x1 <- 10
x2 <- 20
x3 <- 30
resave(x1, x3, file = "abc.RData")

load("abc.RData")
x1
# [1] 10
x2
# [1] 2
x3
# [1] 30

Answer 2

我已经在stackoverflow包中添加了@flodel答案的重构版本。它明确地使用环境是为了更具防御性。

resave <- function(..., list = character(), file) {
  e <- new.env()
  load(file, e)
  list <- union(list, as.character(substitute((...)))[-1L])
  copyEnv(parent.frame(), e, list)
  save(list = ls(e, all.names=TRUE), envir = e, file = file)
}